新型多苯并咪唑环芳识别氨基酸甲酯的分子动力学和密度泛函研究

采用Gaussian 03在B3LYP/6-31G(d)水平上分别优化新型多苯并咪唑环芳(MBICP)受体和氨基酸甲酯(AAME)配体,再用基于模拟退火的分子动力学方法 CDOCKER将配体与受体对接,对每一个复合物获得了一组最低能量的初始构象。最后用Turbomole在BLYP/def-TZVP水平对初始构象进一步优化,并对收敛后的复合物最低能量构象作NBO分析。以密度泛函理论计算获得的相互作用能作为核心参数,采用组合策略建立了表达MBICP-AAME复合物结合常数的定量关系模型,计算了该类复合物的结合常数。对MBICP受体和AAME配体间的作用模式以及影响MBICP受体识别AAME配体的主要因素,作了深入讨论。     

1,1’-二萘基骨架的探针分子对氨基酸/氨基酸衍生物识别的研究

对1,1’-二萘基骨架的3个探针分子,采用Hyperchem和Gaussian 03先后进行分子力学优化、分子动力学模拟、半经验和HF/STO-3G水平几何构型优化。用AutoDock Vina将优化后的探针分子、配体分子α-氨基酸/α-氨基酸衍生物进行对接实验,获得相应的复合物的最佳作用模式并计算它们之间的亲和能。结果表明,理论计算所获得的探针分子与配体分子α-氨基酸/α-氨基酸衍生物之间的结合模式,与根据实验数据所推断的作用模式几乎完全相同;所计算的复合物之间的亲和能,也与实验测定的结合常数间有相同的变化趋势。     

多咪唑环芳受体识别氨基酸甲酯配体的密度泛函理论研究

咪唑环芳受体与氨基酸甲酯(XOM)配体相互识别的理论研究并不多见。结合MS-WHIM Scores描述符,用密度泛函理论(DFT)在6-31G(d)水平,对新近合成的多咪唑环芳与XOM间的相互作用进行了研究。NBO电荷分析表明,在形成复合物时,有负电荷从配体分子向受体转移;扰动理论能量分析结果提示,从配体到受体的轨道相互作用所导致的最强离域稳定化能大于从受体到配体的该能量。以相互作用能为核心参量建立了表达复合物结合常数的二参数模型。据此计算的复合物结合常数与实验值间有良好的关联性。为设计和合成能高度识别XOM的咪唑环芳奠定了基础。     

物理化学实验：—《溶液表面张力测定》中数据处理的讨论

本文剖析了物理化学实验教材中“表面张力的测定”数据处理方法。从学模型、边界条件、程序设计语言等方面，对该实验数据的处理方法，进行了详细讨论。     

手性咪唑环芳识别氨基酸甲酯的作用模式研究

采用Gaussian 03在B3LYP/6-31G(d)水平上分别优化手性咪唑环芳受体和氨基酸甲酯配体,并在同样条件下计算NBO电荷。用AutoDock Vina将优化后的受体、配体进行对接,获得相应复合物的最稳定构象。以复合物亲和能和配体侧链电子电荷指数,建立了表达复合物稳定常数的定量关系模型。从单体的NBO电荷分布、复合物最稳定构象等方面分析探讨,发现静电吸引、受体配体间的空间匹配和氢键作用等,是影响手性咪唑环芳选择性识别氨基酸甲酯的主要影响因素。     

物理化学实验——《溶液表面张力测定》中数据处理的讨论

本文剖析了物理化学实验教材中“表面张力的测定”的数据处理方法。从数学模型、边界条件、计算方法、程序设计语言等方面,对该实验数据的处理方法,进行了详细讨论。     

抗肿瘤多酸[Mo7O24]6-还原位置的理论研究

用密度泛涵理论的离散变分方法（DFT-DVM），对[Mo7O24]^6-及其光还原产物[Mo7O23(OH)]^6-的电子结构进行了系统的计算，结果表明：[Mo7O24]^6-中处于中心位置的Mo原子被还原的可能性最大，这与T.Yamase所认为的位置不尽相同。     

溶液表面张力检测处理软件的设计

在最大气泡法测定溶液表面张力的实验中,用VC＋＋6．0开发了溶液表面张力联机检测处理软件,实现了微机与DP-AW精密数字微压差计之间的数据通讯、压差-时间曲线的自适应滚动显示、表面张力-浓度关系的非线性拟合和表面吸附量-浓度关系的快速获取。该软件已在教学中使用。使用结果表明,该软件计算数据准确、操作方便灵活、用户界面友好,可作为为计算机辅助教学的有力工具。     

质子化程度对Anderson型抗肿瘤杂多酸[PtMo6O24]^8—电子结构的影响

运用密度泛涵理论中的离散变分（DFT－DVM）对不同质子化程度的[HxPtMo6O24]^(8-x)-(x=3.5,4.5,6)的电子结构进行了计算并对计算结果作了方差分析和F检验。结果表明，质子化程度的改变对原子静电荷（除Mo原子电荷外），键级，HOMO，LUMO的组成，分子轨道能级以及态度等，没有显著影响。根据计算和分析检验的结果推测，x=4.5和x=6的Andeson平面型[HxPtMo6O^24]^(8-x)-也将具有抗肿瘤活性。