HEPT类似物的电子结构与抗HIV活性的关系研究

目的：为了研究HEPT类似物的电子结构与其抗HIV活性的关系。方法：应用分子力学MM 方法,半经验量子化学MNDO法计算了23个HEPT类似物的优势构象和电子结构,结合数理方法得到了两个定量构效方程：(1)logl／C=5．138 0．000058231c-c 0．00004894Ee 3．747Q13;(2)ClogP=5．271 0．00013631c-c 0．0001134Ee=10．86Qs13;结果：(1)HEPT类似物的两个苯环作为两个核的核与核之间相互作用Ic-c和分子总电子能Ee是影响其log1／C与ClogP的主要因素,核与核之间的相互作用越强,总电子能越高,则其疏水参数和其抗HIV活性也越强。(2)13号原子上取代基的净电荷Qs13越大时,ClogP越小。当13号原子的净电荷Q13越多,其抗HIV活性则越强。结论：HEPT类似物的抗HIV活性与化合物的核与核之间相互作用、总电子能及13号位的原子的净电荷成正比。     

TIBO类衍生物抗HIV-1活性与电子结构关系的研究

应用分子力学MM＋方法，半经验量子化学MNDO计算了19个TIBO HIV－1逆转录酶抑制剂的优势构象和电子结构，得到了其抗HIV－1活性与电子结构的定量构效关系。结果表明：（1）TIBO类衍生物的体积越大、极性越小，即疏水性越大对抑制HIV－1活性越有利；（2）化合物中存在较大的正电区域，当C2原子连接吸电性基团时对药物的活性有利。     

粗糙集方法在吲哚芳砜类化合物抗HIV构效关系研究中的应用

应用粗糙集方法来研究吲哚芳砜类化合物抗HIV构效关系。以AM1和MINDO3方法在STO-3G水平上计算79个吲哚芳砜化合物的结构参数,再结合相应的EC50数据进行属性约简、属性值约简和决策规则的简化。结果表明分子总能量(E_Total)、吲哚环5-位和苯环3-6-位的净电荷(Q2,Qp3-Qp6)是影响吲哚芳砜类化合物抗HIV活性的主要因素。阐述了粗糙集方法研究结构特异性药物构效关系的特点。     

香豆素磺酰脲类化合物降血糖活性的定量构效关系研究

目的：研究新型香豆素磺酰脲化合物降血糖作用与化学结构之间的关系，为进一步设计合成该类化合物提供理论依据。方法：选择10个降血糖活性较强的化合物，利用MM!分子力学和CNDO／2量子化学方法计算有关结构参数并进行定量构效关系研究。结果：香豆素-6-磺酰脲类化合物的降血糖活性与磺酰脲基与母核的二面角呈负相关；与母核1位碳原子LUMO轨道本征矢量负相关；与化合物分子的偶极矩正相关。结论：推测分子中7-位甲基的引入不利于磺酰脲基与香豆素母环共平面，降低化合物的降血糖活性；香豆素母环上引入供电子基团不利于增加降血糖活性，可尝试引入吸电子基团；化合物分子偶极矩的增加对降血糖活性有利。     

17α取代雌二醇与雌激素受体结合活性的定量构效关系研究

应用分子力学法MM+和半经验量子化学AM1法几何全优化得到29个17α取代雌二醇衍生物的优势构象,再利用量子化学法和分子图形学技术获得相应优势构象的电子结构参数和几何结构参数,采用多元线性回归分析研究17α取代雌二醇衍生物与雌激素受体结合活性(relative binding affinities)的定量构效关系.结果表明17α取代雌二醇衍生物与雌激素受体结合活性和分子键合能(BE)、17号碳原子的净电荷(Q)及7号和8号碳原子间键长的相关性较好,成功地建立了29个17α取代雌二醇衍生物的构效关系式,所建回归方程的复相关系数R2及去一法交互检验相关系数Rcv2分别为0.890和0.712.     

4-X-N-Y-6-氮杂雄-17-羰基-Z-4-烯-3-酮衍生物对3BHSD的抑制活性与结构关系的研究

应用分子力学方法MM,和半经验量子化学AM1法,获得22种4-X-N-Y-6-氮杂雄-17-羰基-Z-4-烯-3-酮衍生物的优势构象,再利用量子化学算法和分子图形学技术,获得电子结构参数和几何结构参数,采用多元线性回归分析和人工神经网络误差反传算法(BP),将这些参数和衍生物对3β-羟类固醇脱氢酶(3BHSD)的抑制活性相关联。结果表明,衍生物对3BHSD的抑制活性大小和分子最高占用轨道能(E_(HOMO))、16号碳原子的净电荷(Q)及5号碳原子和6号氮原子间键长的相关性较好,成功地建立了22种衍生物的构效关系式。HOMO轨道组成分析表明,A环上的4号、5号碳原子和羰基氧原子(O_(1(?)))及B环上的6号氮原子和7号碳原子可能是与受体作用时的活性位点。     

4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物对3BHSD的抑制活性与结构关系研究

应用分子力学方法MM 和半经验量子化学AM1法得到了17种4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物的优势构象，再利用量子化学算法和分子图形学技术获得电子结构参数和几何结构参数，采用多元线性回归分析和人工神经网络误差反传算法(BP)，将这些参数和4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物对3β-羟类固醇脱氢酶(3BHSD)的抑制活性相关联。结果表明，4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物对3BHSD的抑制活性大小和分子范德华体积(V)、分子最高占用轨道能(EHOMO)及9号碳原子的净电荷(Q)的相关性较好，成功地建立了17种4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物的构效关系式。HOMO轨道组成分析表明，A环上的4号、5号碳原子和羰基氧原子(O18)及B环上的7号、8号碳原子和6号氮原子可能是与受体作用时的活性位点。     

苯甲酸衍生物对兔子主动脉造粒系统的QSAR研究

应用分子力学方法MM 和半经验量子化学PM3法得到了32种苯甲酸衍生物的优势构象,利用量子化学算法和分子图形学技术获得电子结构、几何结构和拓扑结构参数,并将这些参数与苯甲酸衍生物在兔子主动脉造粒系统中的生理活性的大小相关联。结果表明:苯甲酸衍生物在兔子主动脉造粒系统中的生理活性大小与改进的分子连接性指数1J、第20号碳原子电荷Q和分子激化率P的关系密切。一下建立了32种苯甲酸衍生物的构效关系式。     

氨基喹啉类抗疟疾药物的活性预测

采用分子全息距离矢量方法描述40个氨基喹啉类化合物的分子结构,运用主成分回归方法建模进行定量构效关系分析,预测其抗疟原虫活性。其两组活性数据所得结果相关系数分别为0．9438和0．9737,交互检验相关系数分别为0．8305和0．9098。由此表明所建立的多参数模型稳定,能较好地预测氨基喹啉类药物的抗疟原虫活性。为指导和设计新的高效低毒抗疟疾药物提供有力依据。     

用量子化学研究3-取代吲哆酮类化合物抗肿瘤活性的构效关系

目的:研究3-取代吲哆酮类化合物抗肿瘤活性的构效关系。方法:用量子化学从头算法,在HF/6-31g基组上计算分子结构参数,利用逐步回归分析法建立定量构效关系模型。结果:成功建立此类化合物抗肿瘤活性的构效关系模型。结论:3-取代吲哆酮类化合物抗肿瘤活性与吲哆环上的负电荷及取代苄基δ位的电荷数相关,此类化合物与相应酶作用中,可作为电子受体提供空轨道参与反应,活性作用部位在吲哚杂环上。     

应用量化参数研究d4T核苷酸类似物的结构与抗HIV-1活性的相关性

应用MM 分子力学法、量子化学AM1法计算了20个d4T核苷酸类似物的优势构象和电子结构,并用逐步回归分析方法寻找其量化指数与抗HIV(艾滋病)活性的关系。结果表明:1)d4T核苷酸类似物的油水分配系数LogP与活性参数间呈较好的抛物线关系,LogP处于0．95-2．45区间是d4T核苷酸类似物具有良好抗HIV活性的重要条件。2)建立了量化指数与活性之间的定量模型,取得了良好的结果,其模型相关系数为R=0．948;继以留一法(Leave-one-out,LOO)进行交互检验,复相关系数为R2C(?)=0．771,说明定量相关模型具有良好的稳定性和预测能力。     

新型二芳基取代-1,2,4-三唑类化合物的抗炎构效关系和分子对接研究

目的:建立新型二芳基取代-1,2,4-三唑类化合物的定量构效关系,设计新型COX-2抑制剂.方法:采用PM3半经验量子化学法全优化18种二芳基取代-1,2,4-三唑类选择性环氧合酶(COX-2)抑制剂的结构,从数据中搜寻或计算它们的226种参数,利用逐步回归法,建立经典结构-活性关系(2D-QSAR);用Autodock对接软件研究二芳基取代-1,2,4-三唑类化合物与环氧合酶(COX-2)的对接,分析该类化合物与环氧合酶在复合物的立体结构以及分子对接自由能与抑制活性的关系.结果:建立合理二芳基取代-1,2,4-三唑类化合物COX-2抑制剂定量构效关系,表明活性二芳基取代-1,2,4-三唑类选择性环氧合酶(COX-2)抑制剂具有类似塞来昔布等三环类环氧合酶-2抑制剂的立体结构,并且对接自由能与抑制剂活性有较好的相关性.结论:所得的模型可以解释已有的构效关系,而且预测同类化合物能力较好,可指导设计新抑制剂.     

Quantum correlations for bipartite continuous-variable systems

Two quantum correlations Q and \(Q_\mathcal P\) for \((m+n)\)-mode continuous-variable systems are introduced in terms of average distance between the reduced states under the local Gaussian positive operator-valued measurements, and analytical formulas of these quantum correlations for bipartite Gaussian states are provided. It is shown that the product states do not contain these quantum correlations, and conversely, all \((m+n)\)-mode Gaussian states with zero quantum correlations are product states. Generally, \(Q\ge Q_{\mathcal P}\), but for the symmetric two-mode squeezed thermal states, these quantum correlations are the same and a computable formula is given. In addition, Q is compared with Gaussian geometric discord for symmetric squeezed thermal states.     

修正Cp_EA-PLS用于多环芳烃光解半衰期QSAR的研究

文章讨论了多环芳烃光解半衰期的QSAR模型.运用量子化学软件包以B3LYP/6-311+C(d)方法计算13种PAHs的量子化学描述符,用修正CP统计量作目标函数并用进化算法(EA)选择变量,然后应用偏最小二乘(PLS)方法给13种PAHs的光降解活性进行建模,模型的相关系数为0.9719,比直接用PLS方法所得到的模型更优越.结果表明模型预测PAHs的光解半衰期有效.     

新分子电性距离矢量用于苯取代衍生物QSRR的研究

本实验室新近提出按氢分类分子电性距离矢量(H-MEDV),用于对110个烷基苯气相色谱保留指数和54个二取代苯液相色谱容量因子进行结构表征,运用多元线性回归(multiple linear regression,MLR)以建立定量结构色谱保留关系(QSRR)模型,同时利用逐步回归结合统计检测对模型变量作筛选,建模计算值复相关系数(R_(cum))、留一法(leave-one-out,LOO)交互校验(cross-validation,CV)复相关系数(Q_(LOO)),对上述样本分别为0．9950、0．9937和0．9648、0．9530。研究结果表明,H-MEDV能较好表征该类分子结构信息,值得进一步推广。     

迷幻性苯烷基胺类化合物的QSAR研究

采用量子化学密度泛函B3LYP法,用6-311+G(d,P)基组,计算38个苯烷基胺类化合物的电子结构参数;利用多元线性回归(multiple linear regression,MLB)法,筛选出影响化合物迷幻活性显著的6个变量,并建立其结构参数与迷幻活性之间的定量关系(MLR模型);同时,利用人工神经网络(artificial neural network,ANN)法建立相应的QSAR模型(ANN模型)以资对比.所建MLB模型的相关系数R=0.9340,标准误差Se=0.2068;ANN模型的相关系数R=0.9992,标准误差Se=O.0036.结果表明人工神经网络法获得了比多元线性回归方法更精密的拟合效果,可望在QSAR研究中发挥重要作用.     

基于遗传算法的黄酮类化合物对PTKs抑制性的QSAR研究

用文献设定的结构参数和本文设定的结构参数,分别与由HyperChem7.5Student Evaluation计算得到的量化参数作为自变量构成2组数据,以逐步回归,遗传算法-偏最小二乘法(GA-PLS)和遗传算法-支持向量机(GA-SVM)等算法就黄酮类化合物对PTKs抑制性进行QSAR研究。用各算法模型处理数据,由本文设定的结构参数构成的数据集获得的预测结果更好,表明采用取代基团类型和取代位置结合的编码参数包含的信息更为丰富,对物质性质的描述更加合理。在各种算法中, GA-SVM模型均具有最佳预测效果,该算法对2组数据作留一法预测处理得到的相关系数R和PTKs抑制性实验值与预测值的平均绝对误差MAE分别为0.7595,0.2871和0.7864,0.2883。研究还表明,GA-PLS和GA-SVM联用算法的预测效果远高于单独使用的PLS和SVM算法;由逐步回归建立的MLR模型对2组数据进行计算处理,尽管拟合时相关系数R分别达到0.8136和0.8250,但作留一法交互验证时却下降到0.7113和0.7354,明显低于GA-PLS和GA-SVM联用算法。     

3-取代4-氧-3H-咪唑并[5,1-d][1,2,3,5]四嗪-8-羧酸衍生物抗肿瘤活性的定量构效关系研究

目的:研究3-取代4-氧-3H-咪唑并[5,1-d][1,2,3,5]四嗪-8-羧酸衍生物分子结构与抗肿瘤活性的关系.方法:采用量子化学和分子力学方法计算分子结构参数,利用Cram-Schmidt正交化法筛选参数,利用偏最小二乘法建立QsAR模型.结果:建立合理的3-取代-4.氧-3H-咪唑并[5,1-d][1,2,3,5]四嗪-8-羧酸衍生物抗肿瘤活性模型.结论:3-取代-4-氧-3H-咪唑并[5,1-d][1,2,3,5]四嗪-8-羧酸衍生物抗肿瘤活性与分子油水分配系数LogP和8位取代基R1上的非氢原子净电荷Q1相关,研究结果可为同类抗肿瘤药物的分子设计提供参考.