轮作与连作对烤烟不同生育期根际土壤细菌群落结构的影响

为明晰烤烟连作是否对根际细菌群落结构产生影响,采集不同生育时期的轮作和连作烤烟根际土壤,运用 454焦磷酸测序技术,对根际土壤细菌 16S rDNA V1-V3片段序列结构组成进行分析。结果表明,与轮作处理相比,连作处理烤烟根际酸杆菌门丰度在生育前期低而在后期高,但 α-变形菌门和放线菌门表现出相反的变化趋势;烤烟连作降低了表征菌群丰度的 Chao指数和物种丰富度的 Shannon指数,表明烤烟连作降低了根际土壤细菌多样性。主成分分析和 NMDS(non-metric multidimensionalscaling)的聚类分析结果显示不同处理烤烟根际细菌群落结构随生育期而迁移,轮作与连作烤烟根际土壤细菌群落结构差异在生育前期体现明显,生育后期不明显,表明生育期是影响烤烟根际细菌群落结构变化的主要因素,而连作与轮作是次要因素。      

不同连作葡萄园土壤微生物动态变化研究

以不同连作年限葡萄园土壤为对象,研究其微生物数量及动态变化情况.结果表明,随着连作年限的增加,在葡萄整个生长季内,根际土壤的真菌数量明显增加,细菌和放线菌数量明显减少;连作30年及连作3年的葡萄园根际土壤细菌及放线菌数量均在6H份最高,真菌数量随着时间的推移总体呈下降趋势,11月份最少.     

不同连作葡萄园土壤微生物动态变化研究

以不同连作年限葡萄园土壤为对象,研究其微生物数量及动态变化情况。结果表明,随着连作年限的增加,在葡萄整个生长季内,根际土壤的真菌数量明显增加,细菌和放线菌数量明显减少;连作30年及连作3年的葡萄园根际土壤细菌及放线茵数量均在6月份最高,真菌数量随着时间的推移总体呈下降趋势,11月份最少。     

藏东南产区苹果表皮及根际土壤微生物多样性研究

为了探究藏东南产区苹果表皮及根际土壤微生物群落结构组成,利用高通量测序技术对苹果表皮及根际土壤微生物的群落结构与多样性进行研究,并对优势微生物菌属进行关联性分析。结果表明,苹果表皮样品分别获得554个细菌操作分类单元（OTUs）、612个真菌OTUs,根际土壤样品分别获得1 717个细菌OTUs、1 371个真菌OTUs,根际土壤样品细菌和真菌的多样性、丰富度均高于苹果表皮,且同一样品中细菌群落多样性和丰富度高于真菌。在属分类水平上,苹果表皮和根际土壤的主要优势细菌属均为节杆菌属（Arthrobacter）,其相对丰度分别为13.06%和5.53%,外囊菌属（Taphrina）和被孢霉属（Mortierella）分别是苹果表皮和根际土壤样品的主要优势真菌属,其相对丰度分别为41.07%和7.62%。优势细菌属和优势真菌属关联性分析结果表明真菌与细菌间存在显著的互作关系。     

钙镁磷肥对青枯病发病烟株根际土壤微生物区系的影响

采用平板计数法分析了不同生育期及发病烤烟根际可培养微生物数量的变化,并通过宏基因组测序法比较了施用钙镁磷肥的健康与发病烟株根际土壤微生物群落的差异,旨在研究钙镁磷肥对烟株根际土壤微生物群落多样性的影响。结果表明:1)施用钙镁磷肥的烤烟根际细菌和真菌数量随生育进程呈抛物线形式变化,对照则呈"N"趋势,处理和对照的根际放线菌数量变化趋势相同,呈逐渐增加的趋势。2)在旺长期,施用钙镁磷肥的根际细菌数量显著高于对照;在成熟期,处理的根际真菌数量显著高于对照;而钙镁磷肥对根际放线菌数量没有显著影响。3)相对于健康烟株根际土壤,发病烟株根际土壤中放线菌数量显著减少,细菌数量显著增加;发病根际土壤中施用钙镁磷肥的细菌和放线菌数量均显著高于对照。4)宏基因组测序结果显示根际细菌种类总数远高于根际真菌,健康根际细菌和真菌香农指数、Chao1指数和ACE指数均高于发病根际土壤。综上所述,钙镁磷肥对根际土壤微生物数量和多样性有一定的促进作用。     

西藏产区葡萄表皮及根际土壤真菌群落结构组成分析

为探究西藏地区葡萄表皮及根际土壤真菌群落结构组成,采用高通量测序技术对西藏芒康和林芝地区葡萄表皮及根际土壤样品进行真菌群落多样性分析。结果表明,芒康葡萄根际土壤（MS）真菌多样性最高,林芝葡萄（LG）真菌多样性最低。在门分类水平上,2个地区样品中的优势类群均为子囊菌门（Ascomycota）,其相对丰度为76.06%～99.60%;在属分类水平上,不同样品中的优势菌群不同,林芝葡萄（LG）和芒康葡萄（MG）表皮样品中的优势菌属分别为枝孢属（Cladosporium）和汉逊酵母属（Hanseniaspora）,其相对丰度分别为64.43%和31.59%,而林芝（LS）和芒康（MS）葡萄根际土壤样品中的优势菌属分别为镰胞菌属（Fusarium）和被孢霉属（Mortierella）,其相对丰度分别为50.02%和20.16%;主成分分析表明,不同样品中真菌群落结构组成差异较大,不同地区葡萄表皮和根际土壤真菌群落结构组成相似;冗余分析表明,土壤中总钾（TK）、pH、总氮（TN）、总磷（TP）和速效氮（AN）对真菌群结构组成影响较大,而土壤电导率（EC）和有机质（SOM）影响不明显。综上所述,葡萄表皮和根际土壤富含丰富的真菌微生物,且不同地区样品间群落结构组成相似。西藏葡萄表皮及根际土壤微生物多样性的研究为开发本地特色微生物提供了理论依据。     

云南大理烤烟土壤微生物动态变化研究

为了明确大理烤烟土壤微生物在整个烟草生育期内的变化趋势,利用选择性培养法,对云南大理不同地区植烟土壤根际和非根际土壤细菌、真菌、放线菌进行了测定,并结合土壤养分进行了分析。结果表明:烟株的根际与非根际土壤中,细菌和真菌在团棵期的数量较少,成熟期或采烤后期,细菌数量达到最大值,而真菌则在旺长期或成熟期达到最大值,团棵期至旺长期根际与非根际土壤中真菌数量基本上保持上升趋势;放线菌数量在团棵期较多,且根际土壤略大于非根际土壤;根际和非根际土壤中放线菌数量与土壤中的有机质、速效氮存在显著相关性,尤其是根际土壤中的有机质与放线菌的相关性达极显著水平;根际土壤细菌与速效氮、速效磷、速效钾存在显著的负相关关系,所以土壤中适当的营养对烟株防治细菌性病害有一定益处。      

间作对烤烟烟株根际土壤细菌群落结构组成及功能的影响

【目的】探究利用烤烟与小葱、苦苣和油麦菜三种植物间作缓解其连作障碍，为消除烟田土壤连作障碍提供参考。【方法】采用16S RNA高通量测序技术对间作烤烟烟株根际土壤（连作烤烟烟株根际土壤为对照）细菌群落结构组成进行测定分析；利用Tax4Fun功能预测获得相应样品细菌群落的生态功能。【结果】间作处理的烟株根际土壤细菌群落的OTU数、丰度和多样性均大于对照，与CK处理相比，小葱（T1处理）、苦苣（T2处理）和油麦菜（T3处理）间作处理的丰度分别增加了16.52%、12.10%、6.28%，而OTU总数分别增加了6.00%、0.65%、3.49%；在门水平上的6个优势菌群中，与CK的丰度相比，T1、T2、T3处理在变形菌门上分别提高了42.86%、17.85%和21.43%，厚壁菌门上分别提高了27.27%、0%和9.09%，酸杆菌门上分别提高了9.09%、27.27%和36.36%，放线菌门上T2处理提高了7.14%而T1和T3处理分别下降了28.57%和14.30%，拟杆菌门上T1处理提高了8.33%而T2和T3处理分别下降了16.67%和8.33%，芽单胞菌门上T1和T3处理分别下降了5...     

烟草成熟期土壤细菌群落结构及多样性

为研究烟草成熟期(下部叶采收期) 根际及非根际土壤细菌群落结构和多样性,利用PCR-DGGE 技术对攀枝花市盐边县主要烟区采集的5 个烟草根际土样和5 个非根际土样进行分析。结果表明,非根际与根际土壤细菌群落结构差异显著,非根际土壤的细菌多样性甚至超越根际, 表明烟草成熟期根际效应没有显现,并且有减弱甚至负向效应出现,这可能与烟草成熟期根系分泌物的影响有关。条带克隆测序表明,根际土壤中优势细菌的群落结构更为丰富,而非根际土壤中则相对较弱。Steroidobacter菌是烟田土壤中的优势细菌;硝化螺菌属(Nitrospira) 细菌、Rhizobiales 目下未定类细菌等为烟草根际土壤中优势细菌;放线菌目(Actinomycetales) 未定类放线菌和Chitinophagaceae 科未定类细菌为非根际土壤中优势细菌。研究证明成熟期的烟草根际效应出现一定程度减弱。      

复合液体肥对‘夏黑’葡萄园土壤微生物多样性的影响

为探究液体肥对葡萄根际土壤微生物多样性的影响，采用IlluminaMiseq高通量测序技术，分析了施用液体肥后‘夏黑’葡萄根际土壤微生物群落的情况。结果表明：与常规施肥相比，施用液体肥后显著提高了‘夏黑’葡萄根际土壤中微生物的丰度和多样性；土壤细菌OTU归类到36门97纲230目359科700属，葡萄根际土壤中门水平上的变形菌门、放线菌门、绿弯菌门、拟杆菌门、芽单胞菌门、Atescibacteria丰度比常规肥处理分别增加了9.53、0.87、0.12、1.99、0.61、1.12个百分点；葡萄根际土壤中属水平上的鞘氨醇单胞菌属、芽单胞菌属、RB41、Candidatus Udaeobacter、黄色杆菌科及其两个优势菌属相对丰度分别增加了2.28、0.22、0.46、0.22、0.51、0.11、0.10个百分点。施用液体肥后，土壤真菌OTU归类到7门25纲145目145科277属，葡萄根际土壤中毛葡孢属、镰刀菌属、短柄菌属、Gibellulopsis、盘菌属的相对丰度比常规肥处理分别增加了8.08、2.70、1.50、1.24、0.62个百分点。综合分析，施用复合液体肥改变了葡萄根...     

万寿菊-烟草轮作调理植烟土壤细菌群落结构的作用

基于大田试验和Illumina Hiseq扩增子测序技术,分析了万寿菊-烟草轮作对植烟土壤细菌群落多样性和结构的影响,旨在为缓解烟草连作障碍提供理论依据。结果表明,万寿菊-烟草轮作可提高烟株根际土壤细菌群落Sobs、Shannon和Chao1等多样性和丰富度指数;提升土壤中酸杆菌门(Acidobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度;促使生防菌(Pseudomonas)、功能菌(Candidatus_Solibacter、Bryobacter和Bradyrhizobium)、降解菌(Massilia、Novosphingobium和Ramlibacter)和根际促生菌(Flavisolibacter)等菌属比例上升,有利于改善土壤微生态环境、缓解连作障碍。     

不同肥力条件下烟草根际微生物的初步研究

对不同肥力条件下烟草根际细菌、真菌、放线菌进行分离,研究了其数量变化,对根际土壤中7类细菌生理群进行了数量和多样性分析.结果表明,根际细菌和放线菌数量以高肥土壤中最多,中肥土壤次之,低肥土壤最少;根际真菌数量以低肥土壤中数量最多,高肥土壤次之,中肥土壤最少;好气性固氮菌、氨化细菌、纤维素分解菌、硝化细菌和硫化细菌的数量以高肥土壤最大,中肥土壤次之,低肥土壤最少;反硝化细菌和反硫化细菌数量呈现低肥大于中肥大于高肥的变化趋势.不同肥力条件下,烟草根际细菌、真菌、放线菌及8类细菌生理群的Shannon-Wiener指数和均匀度均以低肥土壤的最大.     

单株立体覆膜栽培对烟田土壤微生物数量的影响

为揭示单株立体覆膜栽培技术对烟草根际与非根际土壤微生物数量的影响,于2015—2016年在湖南桂阳进行了单株立体覆膜、常规覆膜与不覆膜处理的田间试验。采用稀释平板涂布法测定了各处理土壤细菌、放线菌和真菌数量。结果表明,烟株移栽后不同取样时间的土壤微生物总量存在差异,3个处理间根际土壤细菌总量差异达到显著水平(p0.05),其中单株立体覆膜处理最高,常规覆膜处理次之,不覆膜处理最低;单株立体覆膜处理根际土壤放线菌总量显著高于不覆膜处理(p0.05),也高于常规覆膜处理,但只有2016年试验结果的差异达到显著水平(p0.05);根际土壤真菌总量单株立体覆膜和常规覆膜处理显著高于不覆膜处理(p0.05),单株立体覆膜和常规覆膜处理间差异也达到显著水平(p0.05)。单株立体覆膜处理的根际与非根际土壤微生物数量比值(R/S)高于常规覆膜处理和不覆膜处理。因此,单株立体覆膜栽培可提高烟草根际土壤微生物的数量。     

黄腐酸与微生物菌剂协同对烟草青枯病及根际土壤细菌群落的影响

为研究黄腐酸与微生物菌剂协同对烟草青枯病及根际土壤细菌群落的影响,采用随机区组试验,调查了烟草青枯病田间发病情况,并对根际土壤样品中细菌16S rRNA基因的V4区进行扩增和高通量测序,分析各处理细菌群落结构。结果表明:(1)移栽120 d后,黄腐酸与微生物菌剂协同处理烟草青枯病发病率和病情指数显著降低。(2)黄腐酸与微生物菌剂协同处理可显著提高根际土壤细菌群落观测物种数(Observed_species)、香农指数(Shannon index)和辛普森指数(Simpson index)。(3)黄腐酸与微生物菌剂协同处理可改善根际土壤细菌群落结构,显著提高根际土壤中节杆菌属(Arthrobacter)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)和Bryobacter属的相对丰度,同时显著降低未确定属的伯克氏菌科(unidentified_Burkholderiaceae)、链霉菌属(Streptomyces)、未确定属的芽单胞菌科(unidentified_Gemmatimonadaceae)和戴氏菌属(Dyella)的相对丰度。黄腐酸与微生物菌剂协同对烟草青枯病有较好的防治效果,根际土壤细菌群落多样性显著增加,细菌群落结构发生明显变化。     

烤烟根腐病对烟株根际土壤真菌群落结构的影响

为从微生物生态学角度探求烤烟根腐病的发生原因并为其防控提供理论依据,利用Illumina MiSeq高通量测序分析了烟草根腐病发病和健康植株根际土壤真菌群落结构的差异,结果表明,烤烟根腐病发生对烤烟根际土壤真菌的丰富度有显著影响,其中健康和患病烟株根际土壤样品中真菌OTU数分别为904个和647个,健康烟株真菌OTU总数为患病烟株的1.40倍,特有OTUs数是患病烟株的2.59倍;患病烟株根际土壤真菌群落多样性水平显著低于健康烟株土壤,患病烟株根际土壤的Shannon、ACE和Chao1指数分别较健康植株降低了29.81%、40.12%和40.61%;同时,患病烟株与健康烟株根际土壤真菌群落的优势物种显著不同,患病烟株根际土壤中烤烟根腐病病原菌茄镰刀菌（F.solani）相对丰度较健康烟株根际土壤增加了303.45%,为健康烟株的4.03倍,且棘孢木霉（Trichoderma asperellum）和青霉菌（Penicillium raperi）的相对丰度亦较健康烟株分别增加了17.62%和50.46%。烟草植株根际土壤中真菌群落结构改变及物种多样性降低是烤烟根腐病发生的重要特征。研究可为该病害的早期预防或生态调控提供科学依据。     

前作的根际物质及根际微生物对烤烟生长的影响研究

研究了小麦和油菜的根际物质和根际微生物对烤烟生长的影响。结果表明 ,小麦和油菜根系浸提液对烟株生长有促进作用 ,油菜根际土壤中的细菌和真菌对烟株生长的促进作用优于小麦根际土壤中的细菌和真菌 ,其中以真菌效果最好     

烤烟根际和非根际土壤微生物典型相关分析

为揭示烟田土壤微生物相互关系,用典型相关分析(CCA)方法研究了烤烟全生育期根际和非根际土壤中微生物之间的相关关系。结果表明;1)在根际土壤中,细菌和氨化细菌数量呈正相关关系;在非根际土壤中,细菌数量同氨化细菌、亚硝化细菌和好气性纤维素分解菌呈正相关关系。2)根际土壤细菌、放线菌数量与非根际土壤细菌数量呈正相关,但是真菌数量在根际和非根际土壤之间相关性不强。3)根际土壤中好气性纤维素分解菌、氨化细菌数量与非根际土壤呈明显的正相关,而好气性固氮菌、亚硝化细菌、硝化细菌和钾细菌数量在根际与非根际土壤间的相关性不强。在植烟土壤3大菌和6类生理功能菌群之间、烟株根际和非根际土壤微生物之间均存在相关关系。     

烟草青枯病发病烟株根际土壤细菌群落分析

  目的  研究青枯病发生对根际土壤细菌群落组成的影响, 探明影响根际土壤细菌群落的环境因子。  方法  采用宏基因组学高通量测序技术, 比较发病烟株和健康烟株根际土壤细菌群落差异。  结果  (1) 健康烟株根际土壤细菌Ace指数、Chao指数和Shannon指数有高于发病烟株的趋势, 而Simpson指数有低于发病烟株的趋势; (2)发病烟株根际土壤中芽孢杆菌属(Bacillus)、假单胞菌属(Pseudomonas)和链霉菌属(Streptomyces)等益生菌减少, 而劳尔氏菌属(Ralstonia)和Rudaea等病原菌增加; (3)土壤pH、有效磷(AP)、交换性钙(Ca)和有效铜(Cu)含量在发病烟株根际土壤中显著减少, 而速效钾(AK)含量显著增加。  结论  与健康烟株根际土壤相比, 发病烟株根际土壤细菌多样性、有益菌丰度、土壤pH和养分含量都较低; pH、P、K、Ca、Cu是对根际土壤细菌群落影响较大的土壤环境因子。      

延边地区植烟土壤微生物根际效应分析

在自然生长条件下,用平板-稀释分离培养法研究了延边地区烟叶质量差异较大的3种类型植烟土壤细菌、真菌、放线菌和6种生理类群微生物数量在烟草生育期内的变化动态。结果表明:延边地区植烟土壤微生物根际效应明显。微生物总量R/S值变化范围在1.19-3.07之间,细菌、真菌和放线菌R/S值变化范围分别是:1.21-3.12、1.37-4.36、0.73-4.71。在烟草生育期内,真菌和放线菌R/S值变幅较大,细菌R/S值变幅相对较小。微生物根际效应在3种类型土壤间存在显著差异,暗棕壤根际效应大于黑砂土和白浆土。氨化细菌、硝化、亚硝化细菌和好气性纤维素分解菌表现出明显的正向根际效应,而好气性固氮菌和钾细菌根际效应受土壤类型和烟株生育期影响呈现正、负两方面的根际效应。结论:在3种类型土壤中,暗棕壤烟株微生物根际效应最明显,根际土微生物多样性、均匀度增加,优势集中度下降,根系微生态环境稳定性增强,更有利于烟株生长发育,这可能是暗棕壤烟叶质量优于黑砂土和白浆土的原因之一。     

烟草青枯病不同发病阶段根际土壤微生物群落变化趋势分析

通过扩增子测序技术,探究了烟草青枯病不同发病阶段根际土壤细菌和真菌群落的变化趋势,旨在为明确微生态-青枯病互作关系提供理论基础。结果表明,青枯病烟田根际土壤细菌群落Sobs、shannon指数和OTUs数量于烤烟移栽后75 d和100 d显著降低,真菌群落多样性指数无显著变化。一些致病微生物（Ralstonia、Fusarium等）和有益微生物（Sphingomonas、Gemmatimonas、Pseudomonas、Lysobacter、Streptomyces、Trichoderma、Gibberella、Chaetomium等）的相对丰度在青枯病发生阶段明显升高。与移栽前相比,属水平上根际土壤细菌群落结构于移栽后75 d和100 d,真菌群落结构于移栽后50 d和75 d发生明显改变。