基于数据挖掘分析牛蒡子功能因子及其潜在机制

目的基于生物信息数据挖掘技术探讨药食同源牛蒡子的功能因子及其潜在作用机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(traditionalChinesemedicinesystemspharmacologydatabaseandanalysis platform, TCMSP)和STRING数据库平台过滤牛蒡子的有效功能因子及对应作用靶点;运用Cytoscape 3.7.0软件建立并分析牛蒡子有效功能因子-作用靶点网络;利用STRING数据库平台和Cytoscape 3.7.0软件建立并分析牛蒡子有效功能因子作用靶点蛋白质相互作用(protein protein interaction, PPI)网络;利用Bioconductor对作用靶点进行基因本体(gene ontology, GO)功能和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析。结果牛蒡子8个有效功能因子通过128条通路作用于80个靶点发挥其保健功能。牛蒡子中的新牛蒡素甲、牛蒡子苷、β-谷甾醇、山奈酚、角鲨烯、β-胡萝卜素、β-二氢紫罗兰酮、洋蓟素等有效功能因子可能通过晚期糖基化终末产物(advancedglycosylationendproducts,AGE)-糖基化终末产物受体(receptorofAGEs,RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor, TNF)信号通路、甲状腺激素信号通路、C型凝集素受体信号通路等通路作用于前列腺素内过氧化物酶2(PTGS2)、半胱天冬氨酸蛋白酶3(CASP3)、转录因子AP-1(JUN)、B淋巴细胞瘤-2基因(BCL2)、α1-B肾上腺素受体(ADRA1B)、核受体辅激活因子2(NCOA2)等作用靶点发挥其抗氧化、清咽、降糖、降脂等保健功能和抗肿瘤、抗炎、舒张血管平滑肌等药理作用。结论牛蒡子发挥保健功能与药理作用具有多组分、多靶点、多途径的特点,研究结果可为牛蒡子食用及药用价值的进一步研究与开发提供理论基础与科学依据。     

基于分子对接和网络药理学探讨金银花防治新型冠状病毒肺炎潜在作用机制

目的基于分子对接和网络药理学探讨金银花防治新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的潜在作用机制。方法利用AutoDock Vina将金银花中14种化学成分与新型冠状病毒(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus2,SARS-CoV-2)S蛋白受体结合结构域与血管紧张素转化酶II(angiotensin Iconvertin genzyme2,ACE2)蛋白酶结构域复合物(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 spike receptor-binding domain bound to the angiotensin I converting enzyme 2 receptor,SARS-CoV-2-S-RBD-ACE2)进行分子对接。利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP)获取上述14种化学成分的作用靶点,使用GeneCards及美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)数据库获取COVID-19靶点,将药物与疾病交集靶点导入Cytoscape 3.7.0软件建立药物-化学成分-靶点-疾病网络,导入STRING数据库获取靶点蛋白质相互作用(protein protein interaction, PPI)网络,导入Bioconductor进行基因本体(geneontology,GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。结果分子对接结果显示金银花中14种化学成分与SARS-CoV-2-S-RBD-ACE2均有较好的结合活性,其中12种成分结合活性优于诊疗方案中4种COVID-19治疗药物;网络药理学结果显示金银花8种成分可通过干预46个靶点、149条通路发挥防治COVID-19的作用。结论金银花中多种化学成分可能通过与SARS-CoV-2-S-RBD-ACE2结合,影响复合物的稳定性,从而发挥治疗COVID-19的作用。金银花治疗COVID-19具有多成分、多靶点、多途径的特点,对COVID-19引起的免疫系统紊乱、炎症等具有潜在的治疗作用,研究结果可为金银花防治COVID-19作用机制提供一定的理论基础与科学依据。     

基于指纹图谱和化学计量学的白芍产地溯源和质量评价

目的 建立白芍高效液相色谱(high performance liquid chromatography,HPLC)指纹图谱,并结合化学计量学进行分析与评价.方法 采用HPLC法测定31批不同产地白芍中没食子酸、儿茶素、氧化芍药苷、芍药内酯苷、芍药苷、五没食子酰葡萄糖、苯甲酰芍药苷和丹皮酚8种成分含量,并用中药指纹图谱...     

不同产地玫瑰花氨基酸成分分析与评价

目的 建立测定玫瑰花氨基酸成分的超高效液相色谱-串联三重四极杆质谱法(ultra performance liquid chromatography-tandem triple quadrupole mass spectrometry,UPLC-TQ/MS),为不同产地玫瑰花溯源和品质评价提供思路.方法 采用UPLC-...     

响应面法优化雨花茶茶多酚提取工艺及其化学模式识别研究

目的:优化雨花茶茶多酚提取工艺,并通过HPLC技术和化学模式识别等方法对其质量进行评价。方法:基于单因素实验,以茶多酚提取量为指标,运用响应面法优化雨花茶茶多酚的提取工艺;建立4个产地12批雨花茶HPLC指纹图谱,采用相似度评价和化学模式识别的方法,对其质量进行综合评价。结果:优化雨花茶茶多酚最佳提取工艺为乙醇浓度55%,料液比1∶30(g·mL^-1),提取时间90 min,提取温度40℃;建立了雨花茶HPLC指纹图谱,共标定13个指纹峰,其相似度均大于0.990;聚类分析、主成分分析和正交偏最小二乘法分析结果一致,可将12批雨花茶分为3类;综合评价结果显示,高淳所产雨花茶质量较好。结论:本研究结果可为雨花茶的质量评价提供理论依据,并为其后续资源开发提供参考。     

氧化苦参碱改善非酒精性脂肪肝病的作用及转录组学研究

目的 研究氧化苦参碱(oxymatrine, Oxy)的抗非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease, NAFLD)作用及机制。方法 将大鼠随机分为正常组、模型组、白藜芦醇组(50 mg/kg)和Oxy低、高剂量组(50 mg/kg和100 mg/kg); 采用高脂饮食(high-fat diet, HFD)饲喂16周诱导NAFLD大鼠模型, 从第8周开始按分组对应灌胃给药; 测定各组大鼠体重、肝脏重量和肝脏指数; 采用试剂盒检测大鼠血清天门冬氨酸氨基转移酶(aspartate transaminase, AST)、丙氨酸氨基转移酶(alanine transaminase, ALT)、低密度脂蛋白胆固醇(low density lipoprotein cholesterol, LDL-c)、高密度脂蛋白胆固醇(high density lipoprotein cholesterol, HDL-c)、总胆固醇(total cholesterol, TC)和甘油三酯(triglyceride, TG)水平; 采用苏木素-伊红(hematoxylin-eosin, HE)、油红O和Masson染色检查大鼠肝脏病理变化; 采用高通量测序技术分析大鼠肝脏基因表达。结果 与正常组比较, 模型组大鼠体重、肝脏重量及肝脏指数显著增加(P<0.01); 血清中AST、ALT、LDL-c、TC和TG水平显著升高, HDL-c水平显著降低(P<0.01); 肝脏肝小叶结构出现损伤, 呈现弥漫性小泡、大泡脂肪变性及气球样变; 肝脏中脂滴和蓝色胶原纤维显著增多(P<0.01)。与模型组比较, Oxy组大鼠体重、肝脏重量及肝脏指数显著降低(P<0.05, P<0.01); 血清中肝损伤及脂代谢相关指标水平显著恢复(P<0.01); 肝脏结构趋于正常, 肝脏仅有轻微的小泡脂肪变性; 肝脏中脂滴和蓝色胶原纤维显著减少(P<0.01)。转录组结果显示, 正常组、模型组和Oxy组样本各自聚集在一起; 正常组与模型组间有499个差异基因, 模型组与Oxy组间有434个差异基因, 共有差异基因218个, 集中于环磷酸鸟苷(cyclic guanosine monophosphate, cGMP)/蛋白激酶G (protein kinase G, PKG)、磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol3-kinase, PI3K)/蛋白激酶B (protein kinase B, Akt)、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate, cAMP)、松弛素、胰岛素抵抗、Rap1和Hippo信号通路。结论 Oxy具有明确的抗NAFLD作用, 具体表现为对HFD诱导的NAFLD大鼠的肥胖的缓解以及肝功能、脂代谢紊乱、肝脂肪变性和肝纤维化的改善, 机制可能与调控cGMP/PKG、PI3K/Akt、cAMP、松弛素、胰岛素抵抗、Rap1和Hippo信号通路有关。