一种基于三维结构的分子相似性新定义

相似性模型在化学诸多领域的广泛应用激发了许多研究者努力探讨分子相似性更中肯的计算方法。我们根据语义模型定义了一种新的分子相似性指数。这种方法首先将分子结构安某种方式拆分，得到可以表征分子结构特征的结构碎片（子结构），它们构成了描述分子结构相似性的度量空间，再根据这些碎片的语义关系定义了分子相似。通过１６个含５个碳的醇之间的分子相似性的计算举例说明这个新方法。     

合成目标化合物析分系统

在化学反应处理的计算模型的基础上,完成了一个实验性的目标化合物析分系统（Target Parsing System,TPS）。目前它主要用于测试和优化反应规则的选择和表述方法。TPS的工作逻辑基本上模仿人的思维过程,它通过对目标分子析分找出谋略键。根据谋略键将目标分子分拆成前体,再通过对原料库的检索确定是否已是可得原料等3个步骤完成反合成分析。通过对一些小分子和天然产物的测试,表明它已能给出令人满意的反合成分析结果。由于TPS在知识量上的局限性,对复杂化合物的析分还不可能达到实用水平。但是,可以预见通过对知识库的扩充和对TPS的不断完善,它有望发展成为一个真正意义上的计算机辅助合成设计系统。     

三维分子结构检索系统的结构索引与匹配

介绍了三维分子结构检索系统的结构索引与匹配,应用位筛成功地实现了三维结构数据的索引,可以快速得到候选结构,然后使用原子－原子匹配算法获得精确的命中结构。     

用计算机分峰法研究复合超细纤维的结晶结构——第Ⅱ报 PET/PA6复合超细纤维的WAXD图谱解析

采用自编的WAXD图谱分峰程序对PET/PA6复合超细纤维的WAXD图谱进行分峰处理:结晶峰用高斯─柯西复合函数,无定形散射曲线用广义高斯函数。在此基础上研究了PET/PA6复合超细纤维的结晶结构。     

用计算机分峰法研究复合超细纤维的结晶结构：第I报 峰形曲线的表征函？…

本文采用Ｃ语言在小型机ＭＶ３３００上编制ＷＡＸＤ图谱分峰程序,算法采用阻尼最小二乘法,并建立峰形表征函数库函数。     

环状分子结构规范化编号中伪树码的产生方法

介绍了环状分子结构的规范化编号中区分局部性质相同,但远程性质不同的环员原子的优先次 方法,并举例说明了伪树码的表示方法。结果表明,伪树码适于解决环状分子结构规范化编号中区分局部性质相同但远程性质不同的环员原子的优先次序问题。     

三维分子结构检索系统的柔性构象检索

介绍ＭｏｎｔｅＣａｒｌｏ法和遗传算法两种柔性构象检索方法,并对４种药效团进行了柔性构象检索,经过对比发现遗传算法可以在比较合理的时间内得到较多的命中结构,比ＭｏｎｔｅＣａｒｌｏ法更适用于柔构象检索。     

迎接数字化新世纪的计算机化学

计算机化学开放实验室已经走过了１０年,正阔步迈向２１世纪。回顾过去的３０多年,计算机化学的兴起与发展是与化学知识创新的迫切需要紧密相联。６０年代末随着计算机在工业化国家的普及,使得许多原来可望而不可及的计算得以实现。这些计算为人类探索化学物质的奥秘、发现新知识打开了新的大门,计算机化学也因此而确立了其地位。８０年代末随着我国计算机化学的发展,中国科学院极有远见地组织成立了国内第一个专业实验室———计算机化学开放实验室,由此开创了我国计算机化学发展的新时期。１０年来计算机化学开放实验室联合了国内有…