中国部分地区甲型肝炎病毒基因型分析

目的　分析中国部分地区甲型肝炎病毒 (HepatitisAvirus,HAV)的基因型。方法　采自辽宁 (LN1、LN2、LN3 )、上海 (Lu3 8)和云南 (YN)甲型肝炎病人的粪便标本共 5份 ,从中分离纯化HAV并提取病毒RNA ,以逆转录 半嵌套聚合酶链式反应 (RT hnPCR)合成VP1 2A交接区及VP1氨基端 ,经克隆筛选后进行测序分析。结果　所分离到的 5株HAV野毒株VP1 2A交接区 168个核苷酸 (nt)的片段与IB亚型的野毒株HM175比较 ,核苷酸差异 >7.5 % ;与IA亚型的日本野毒株AH1、AH2、AH3、FH1、FH2和FH3比较差异 <7.5 % ,因而均属IA基因亚型。但与IB亚型的野毒株MBB比较 ,LN1、LN3和Lu3 8在该区域的核苷酸差异 <7.5 %。进一步将LN1的VP1 2A交接区 3 3 9nt的片段、LN3和Lu3 8的VP1氨基端的核苷酸序列与MBB进行比较 ,核苷酸差异 >7.5 % ,表明这 3株HAV仍属IA基因亚型。结论　所分离到的HAV野毒株LN1、LN2、LN3、Lu3 8和YN均属IA基因亚型     

甲型肝炎病毒(L-A-1株)基因型分析

目的 分析甲肝病毒基因型,为确定我国甲肝的分子流行病学及疫苗的安全性和免疫原性奠定基础。方法 采用抗原捕获聚合酶链反应（AC/PCR）,依据国际上甲肝病毒分型标准,扩增VP1/2A结合处的168个核苦酸（nt2909～3264）。结果 经生物信息学软件分析,得出L-A-1株病毒属于甲肝病毒基因IB亚型。结论 在我国有IA和IB两个亚型甲肝病毒流行。     

模因论视阈下的大学英语写作教学探究

模因论认为语言是一个复制、传播的过程,语言模因通过模仿而传播,模因论可被运用于语言实际和大学英语写作教学中。该文从模因的类型着手,分别探讨了基因型模因和表现型模因对大学英语写作教学的启示,并提出了提高学习者写作水平的有效途径和切实可行的方法。     

结核分枝杆菌链霉素耐药临床分离株 rrs基因突变与其耐药水平相关性研究

研究武汉地区耐链霉素（ SM）结核分枝杆菌的耐药分子机制,进一步研究阐明rrs基因突变与结核分枝杆菌耐链霉素的关系;同时探究武汉地区结核分枝杆菌“北京基因型”菌株的流行趋势,为进一步研究武汉地区耐链霉素菌株rrs基因突变与“北京基因型”的相关性奠定基础。84株结核分枝杆菌中,44株对链霉素耐药,20株耐其它药物,20株对链霉素敏感,采用PCR直接测序法分析链霉素菌株rrs基因突变情况;采用RD105缺失法鉴定84株临床分离菌株中“北京基因型”菌株。结果显示44株SM耐药菌株中,16（36．4％）株检测到rrs基因突变,其中9株1401位点A→G,6株514位点A→C突变,1株1487位点G→A突变;20株耐其它药菌株中1401位点A→G和514位点A→C突变各1株,20株敏感菌株中发现1株1029位点C→T点突变;84株临床分离菌株中有77（91．8％）株“北京基因型”菌株,7株非“北京基因型”菌株。研究表明链霉素耐药菌株rrs基因主要突变位点在514和1401位点,武汉地区“北京基因型”菌株为当地流行的结核分枝杆菌,且SM耐药菌株中突变菌株93．8％（15/16）为“北京基因型”,“北京基因型”菌株研究及其鉴定是有其科学价值的,值得我们重视。     

单体型组装问题计算模型的比较与分析

单体型检测在遗传病基因的定位、药理反应的研究、个体识别等方面有极其广阔的应用前景。单体型组装问题指如何利用个体的基因测序片断数据,根据不同的优化准则确定该个体单体型的计算问题。对MSR,MFR,MEC,WMLF,MEC／GI等单体型组装模型做了详细的分析比较,得出了如下结论：在没有引入测序误差情况下,上述模型的重构精度基本一致。随着测序误差的增加,MEC／GI模型的容错性最好,重构精度最高;MSR模型受测序误差的影响最大,只适用于测序误差极小的情形。     

虹鳟传染性胰脏坏死病毒的分离鉴定及聚类分析

为研究传染性胰脏坏死病毒(IPNV)感染虹鳟Oncorhynchus mykiss的病理特性,取云南省某养殖场大规模死亡的虹鳟稚鱼进行了病原的分离与鉴定,试验中利用鲑鳟鱼常见病毒敏感细胞大鳞大麻哈鱼胚胎细胞(Chinook salmon embryo cells,CHSE-214)、鲤上皮瘤细胞(Epitheliaoma papulosum cyprinid,EPC)和虹鳟性腺细胞(Rainbow trout gonad cell line,RTG-2)对虹鳟稚鱼无菌组织悬液进行病毒培养,并对产生细胞病变的上清进行病毒RNA提取及鲑鳟鱼常见病毒的RT-PCR检测,利用敏感细胞进行病毒分离株的噬斑培养及滴度测定,并对病毒形态进行透射电镜观察。结果表明:细胞培养显示,该组织悬液能使CHSE-214和RTG-2细胞产生明显的细胞病变;RT-PCR结果显示,检测样本呈IPNV阳性,传染性造血器官坏死病毒(IHNV)呈阴性;该IPNV分离株(命名为Ch Rtm213)在CHSE-214、RTG-2和EPC细胞上的病毒滴度分别为10~(5.2)、10~(3.2)、10~(2.3) TCID_(50)/m L,在CHSE-214细胞上培养4 d即可形成肉眼可见的病毒噬斑;在透射电镜下清晰可见大量病毒粒子呈晶格状排列于细胞质内;Ch Rtm213分离株与西班牙毒株2310(AY489225)VP2相似度较高,核苷酸序列一致性为96.4%;聚类分析结果显示,Ch Rtm213分离株与参考毒株加拿大Jasper(ATCC:VR-1325)聚为一簇,属于Gengroup 5基因型。研究表明,Ch Rtm213分离株异于已报道的IPNV分离株,具有不同的血清型及病毒毒力,可为传染性胰脏坏死病毒的检测及防控提供参考。     

新纳米成像系统可检测更多类型肿瘤

正近日的《自然-材料学》报道了一种新的纳米粒子成像系统可以扫描到更多类型的肿瘤。癌症有很多种基因型和表现型,因而找到一种能够应用范围广的成像方法颇具挑战性。但是,肿瘤微环境中还是存在一些共同的因素可以被用于检测,比如高酸度以及快速血管生长。Jinming Gao等人在报告中描述了一类pH超灵敏的荧光纳米粒子,这类粒子能够针对很多患有不同癌症的小鼠体内的肿瘤微环境中的酸度和血管发育进行检测。该纳米粒子在血液循环中不可见,但当其接触到肿瘤的酸环境或者新生血管     

CXCL4基因敲除小鼠的饲养、繁殖及基因型鉴定

目的饲养、繁殖并鉴定CXC趋化因子配体4[chemokine(C-X-C motif)ligand 4,CXCL4]基因敲除小鼠,为深入研究CXCL4的生物学功能奠定基础。方法将引进的杂合子小鼠进行饲养并繁殖,剪取繁殖成功的子代小鼠耳朵,提取其基因组DNA,采用PCR法鉴定小鼠的基因型;比较野生型小鼠和CXCL4敲除的纯合子小鼠的体重变化及结直肠的长度,通过HE染色观察野生型小鼠和CXCL4敲除的纯合子小鼠的结直肠形态结构;采用ELISA法验证CXCL4野生型和纯合子小鼠血清中CXCL4的表达。结果繁殖成功的子代小鼠有3种基因型:野生型、杂合子及纯合子;4、10周龄雌性纯合子小鼠体重明显重于同龄的野生型小鼠(P0.05),6、10周龄雄性纯合子小鼠体重明显重于同龄的野生型小鼠(P0.05);6周龄雌性纯合子小鼠结直肠长度明显长于同周龄的野生型小鼠(P0.05),但结直肠的形态结构无显著改变;纯合子小鼠血清中CXCL4的表达量明显低于WT小鼠(P0.05)。结论成功获得了CXCL4基因敲除纯合子小鼠,为深入研究CXCL4的生物学功能奠定了基础。     

血管紧张素Ⅱ2型受体基因多态性与山东济宁地区汉族女性原发性高血压的相关性

目的研究血管紧张素Ⅱ2型受体(AT2R)基因A1675G多态性与山东济宁地区汉族女性原发性高血压(EH)的相关性。方法随机选取山东省济宁地区汉族女性EH患者127例(EH组)和体检正常的女性119例(正常对照组),提取外周血基因组DNA,PCR扩增A1675G基因,高分辨率熔解(HRM)法测定A1675G基因的多态性。结果EH组AA、AG和GG基因型频率(分别为26.8%、53.5%和19.7%)与正常对照组(分别为27.7%、42.0%和30.3%)比较,差异均无统计学意义;等位基因频率(A:53.5%;G:46.5%)与正常对照组(A:48.7%;G:51.3%)比较,差异也无统计学意义。结论A1675G基因多态性可能与山东省济宁地区汉族女性原发性高血压无明显相关性。     

猪雌激素受体、卵泡刺激素-β、催乳素受体和视黄醇结合蛋白4基因合并基因型对产仔数的影响

目的探讨猪雌激素受体(estrogenreceptor,ESR)、卵泡刺激素-β(folliclestimulatinghormonebetasubunit,FSH-β)、催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)和视黄醇结合蛋白4(retinol-binding proteins 4,RBP4)基因合并基因型对产仔数的影响。方法采用PCR法从来自沈阳地区9个种猪场的大白猪、长白猪、杜洛克猪扩增ESR、FSH-β、PRLR、RBP4基因,PCR-RFLP法检测各基因的多态性,分析4种基因的单基因及合并基因型对产仔数的影响。结果 ESR、FSH-β、PRLR和RBP4基因均存在AA、AB和BB 3种基因型,各基因均处于遗传平衡状态。4种基因的单基因分析表明,长白猪、大白猪FSH-β基因的总产仔数差异有统计学意义(P0.05),BB型为优良基因型;其他3种基因的产仔数差异无统计学意义(P0.05),ESR基因的优良基因型为AA型,PRLR基因的优良基因型为BB型,RBP4基因的优良基因型为AB型。4种基因的合并分析表明,AABBBBAB为最优合并基因型。结论合并基因型的遗传效应显著高于单基因的遗传效应,可利用合并基因型对猪的产仔数进行标记辅助选择。