面向时序基因表达数据的双聚类算法

对某种生物而言, 在某段连续时间内共表达的基因预示着其在同时完成某一生物过程或其间存在某种调控关系; 而目前在基因表达数据上的大多数双聚类算法都是针对非连续样本点的情况提出的, 对于连续样本点（样本之间存在顺序关系）的情况很少涉及。因此在考虑连续样本点的情况下, 提出了一种在时序基因表达数据上挖掘极大一致趋势共表达基因集的双聚类算法TCBicluster。在每个时间点产生行常量共表达基因集, 进而构造以时间点为顶点、以相邻时间点间满足一致性要求的共表达基因集为边的权值图, 并采用扩展连续时间点的方式对权值图进行双聚类挖掘, 使用有效的剪枝策略提高算法效率。实验证明, TCBicluster算法比RAP及CC-TSB算法更能有效挖掘极大一致趋势共表达双聚类且具有较高的效率和良好的可扩展性。     

基于弹簧模型的基因表达数据可视化聚类

依据基因表达数据的特点,提出一种基于弹簧模型的基因表达数据可视化聚类方法,将多维空间的基因表达数据映射到二维空间中,较好地保持了原始多维数据间的时空相似性。实验结果表明,该方法能发现基因表达数据集中隐含的类簇结构以及共表达基因模式。     

使用稳态系统和粒群优化算法进行基因调控网络推断

基因调控网络模型试图从海量的时序基因表达数据中研究基因的功能,推断基因之间的调控关系,从而揭示复杂的病理现象和生命现象.通过利用时序基因表达数据来推断一个基于稳态系统(S-system)模型的基因网络,提出使用粒群优化算法(PSO)来优化模型参数,从而捕捉基因表达数据中的动力学特性.实验结果表明,该方法能够使模型参数快速得到收敛,配置参数后模型仿真能力好,可以较好地识别基因调控关系.     

融合生物网络拓扑特性的肿瘤放疗敏感基因信号识别方法*

肿瘤病人的辐射敏感性预测对于肿瘤的治愈具有重要意义.基于上述原因,文中提出融合生物网络拓扑特性的肿瘤放疗敏感基因信号识别方法.首先基于基因表达谱和肿瘤样本SF2存活率之间的Spearman相关系数,初步估算每个基因的辐射敏感度.然后根据目前已知的基因网络和蛋白质互作网络等生物网络的拓扑性质,利用随机行走算法进行校正.最后筛选辐射敏感基因,并以此为特征训练肿瘤样本SVM分类器.实验表明文中方法比现有常用的线性回归法和微阵列数据显著性分析法更加有效,识别的辐射敏感基因有利于临床肿瘤个性化放疗的施行.     

从基因表达数据中有效挖掘差异共表达双聚类：DiCluster算法

双聚类是一种可以同时在基因和条件两个维度上分析基因表达数据的方法,它可以找出在部分条件下具有相似表达趋势的基因。已有的方法都是从一个数据集中挖掘双聚类。从生物意义上分析,从不同基因表达数据集中挖掘差异表达双聚类可以发现具有生物意义的转录因子等信息。因此,提出一种挖掘不同数据集上差异共表达双聚类的算法——DiCluster。该算法采用深度优先基因扩展方法,并引入了剪枝策略,有效挖掘最大差异表达双聚类。实验结果表明,DiCluster不仅比已有算法具有更高的效率,而且挖掘出的结果具有更好的统计学和生物学意义。     

结肠癌基因表达谱的分类检测问题研究

随着大规模基因表达谱技术的发展,基于基因表达谱的癌症诊断方法正在成为临床医学上一种快速有效的诊断方法,但是由于基因表达数据维数过高、样本量小、噪声大,使得正确提取有关癌症的特征基因成为关键。以结肠癌肿瘤的基因表达谱数据为例,提出了结合Fisher权函数、离散傅里叶变换和主成分分析的混合特征基因提取方法,以多元Logistic回归分析和贝叶斯决策作为分类器进行肿瘤分类检测。实验结果表明,该方法对于结肠癌数据集CV识别准确率高达96.80%。     

胃癌模糊基因调控网络的构建

基因调控网络的研究是以系统的观点为出发点,从基因之间相互作用的角度揭示复杂的生命现象.生命体通过调节差异基因表达来控制其生长、遗传和变异行为.差异表达基因之间的相互作用是构建基因调控网络的纽带,网络中差异表达的基因可以揭示与癌症相关基因的信息.基因网络模型为深入理解生命本质提供了有益的参考,本文提出了一种新颖的方法来预测基因调控网络,即将模糊理论引入基因网络的构建中,阐述了模糊理论基因调控网络建模的机理并初步建立了胃癌模糊基因调控网络,对研究胃癌的发生和发展机理有重要的理论意义和应用价值.     

基于离散时序基因表达数据的双聚类算法

目前应用于基因表达数据上的双聚类算法大多是基于真实数据提出的, 因此易受噪声干扰, 且这些算法很少考虑样本间的时序性。提出了一种有效的时间点连续的双聚类挖掘算法DTCB, 从离散的时序基因表达数据中挖掘出时间点连续的最大共表达双聚类。该算法使用了一种新的数据离散化方法, 同时提出了三种在离散数据集下基因间的共表达关系; 为了提高挖掘效率, DTCB使用了有效的剪枝和输出策略, 可以在不产生候选集的情况下一次性挖掘出所有的最大共表达双聚类。通过实验分析, 证明DTCB具有高效的性能和良好的鲁棒性, 且结果具有较好的统计和生物意义。     

基于矩阵变换的层次聚类在基因表达数据分析中的应用研究

随着基因测序技术的不断发展和完善,基因芯片技术逐渐成熟,产生了大量可供分析的基因表达数据,使得研究和比较大量基因成为了可能.聚类分析能够检测出表达谱相似的基因群,将基因表达谱相似程度高的基因划分到同一类中,从而识别出未知功能的基因,是目前研究基因表达数据使用的主要技术之一.本文在对基因表达数据分析方法的研究基础上,采用了一种改进的、基于矩阵变换的基因表达数据层次聚类(NHC)方法,用于改善聚类效果.     

基因表达谱数据分析技术

人类基因组计划的研究已进入后基因组时代,后基因组时代研究的焦点已经从测序转向功能研究,主要采用无监督和有监督技术来分析基因表达谱和识别基因功能,通过基因转录调控网络分析细胞内基因之间的相互作用关系的整体表示,说明生命功能在基因表达层面的展现,对目前基因表达谱数据分析技术及它们的发展,进行了综述性的研究,分析了它们的优缺点,提出了解决问题的思路和方法,为基因表达谱的进一步研究提供了新的途径。     

Effective solution of certain problems of theory of schedulings of nets

Cybernetics and Systems Analysis -     

Determination of the possible duration of performance of a set of tasks

Cybernetics and Systems Analysis -     

桥面损坏状态评估专家系统探讨

介绍关于桥梁结构损坏状态评估专家系统，在讨论状态评估方法的基础上，重点介绍损坏状态评估因素关系树的建立及各因素状态的模糊表达式等，最后以桥面诊断过程为例介绍系统的构成及诊断流程图，知识表达方式，系统推理过程及工作流程。     

变电站一次设备喷涂PRTV用量的分析

对国网宁夏电力检修公司宁安运维站近2年来一次设备喷涂PRTV用量的统计数据进行分析整理,得出各类一次设备按照标准要求喷涂PRTV时的用量估算值,并针对现存作业中存在的问题,提出相应解决方案。     

机车空调逆变电源设计

本文讨论的是机车空调逆变电源系统的设计与研究。该电源系统主要是由DC/DC的BOOST升压部分和DC/AC三相逆变部分两部分组成。DC/DC部分所得直流电压通过DC/AC部分逆变成三相交流电,供给空调机组工作。同时,为使电源系统能更可靠的运行,也设计了相应的故障检测、保护等辅助电路。     

制造型企业仓储物流管理的RFID应用——卷烟厂按垛出库及到货扫描系统初探

针对国家烟草管理的现状,有关主管部门在全国推行“行业卷烟生产经营决策管理系统工程”,利用条码等自动识别技术手段实时掌握全国的生产经营信息。但某卷烟厂此前的物流环节已经是“件烟成垛”运输,如何在尽可能保持原有企业管理体系的前提下,达到有关部门的数据统计要求,解决成垛卷烟的物流和信息流的交互与统一问题成为技改的核心。该项目成功的将条码识别与射频识别有机结合起来,为烟草行业信息化提供了生动的应用案例。     

Features of estimation of the main key performance indicators of work of production of technological type. I. Complex of key indicators and feature of estimation of qualitative indexes of production flows

The structure of a complex of key performance indicators of work of production of technological type is considered. Features of determination of the qualitative indexes of work of production entering a complex and an error of their estimates are analyzed.     

新型煤泥浮选机液位传感装置的研制

介绍了一种性能良好的新型浮球式煤浆液位传感装置。该装置利用浮球随着煤浆液位的变化而带动连杆作上下运动,通过机械装置将液位的变化转变成角位移传感器的轴的角度变化,分析角位移传感器输出信号可得到煤泥液位信息。经测试该传感装置各项指标达到了设计要求。该新型煤泥浮选机液位传感装置具有良好的动、静态特性,可以在选煤厂推广应用。