一起疑似食源性诺如病毒胃肠炎事件病原分子生物学特征分析

目的研究厦门市思明区一起聚集性胃肠炎事件的诺如病毒的分子生物学特征。方法将收集到的11份肛拭子标本及1份生蚝样品,采用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测诺如病毒核酸,阳性标本再进行实时荧光定量RT-PCR扩增,扩增产物经过凝胶电泳分析后,进行序列测定,确定基因型,并进行系统发育树分析。结果 11份肛拭子标本中检出5株GⅠ组诺如病毒株,2株测序成功,检出4株GⅡ组毒株,3株测序成功;1份生蚝样品中检出1株GⅠ组毒株,测序成功。对测序成功的6株毒株进行同源性分析,GⅠ.2型毒株所测序列与2014年上海株KP325648等6株参考株高度同源,GⅡ.17型毒株所测序列与2015年韩国株KT384078等8株参考株高度同源,证实这是一起由GⅠ.2和GⅡ.17型诺如病毒混合感染引起的聚集性胃肠炎事件,GⅡ.17型毒株为厦门市首次报道。结论此次聚集性胃肠炎事件是由诺如病毒引起,且为GⅠ.2与GⅡ.17型毒株混合感染引起。     

一株耐盐菌EC51的生长特性及其系统发育分析

从大连市普兰店盐场盐池底部的淤泥中筛选出一株耐盐菌EC51,研究了分离菌株的形态和生长特性,该菌株为革兰氏阳性杆状菌.以其16S rDNA 序列相似性为基础构建系统发育树.结果表明,EC51与Bacillus Pumilus的相似性达到99%.耐盐菌EC51的渗透压补偿溶质（Ectoine）生成情况实验表明,用含2 mol/L NaCl的肉汤培养基,在30 ℃条件下培养48 h,诱导生成Ectoine为197.8 mg/L.     

酒醅中芽孢杆属细菌的16S rDNA全序列系统学分析

从浓香型白酒窖池酒醅中分离到69株芽孢杆菌，通过形态特征和生理特性检测等传统鉴定方法，将其归为5个类群。用聚合酶链反应（PCR）扩增出5个类群代表菌株的16SrDNA基因全序列，并对其进行测序。用blast软件在Genbank中进行所得序列的同源性检索，并构建系统发育树。从系统发育树可以看出，样品中芽孢杆菌以地衣芽孢杆菌（Bacillus licheniformis）和解淀粉芽孢杆菌（Bacillus amyloliquefaciens）为主，枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）和环状芽孢杆菌（Bacillus circulans）也占有相当的比例，还有一定数量的蜡状芽孢杆菌（Bacillus cereuso表明窖池酒醅中芽孢杆菌呈现多样性，且优势种群不明显。     

威海近海海葵附生异养菌的分离和多样性分析

对绿海葵的共附生异养菌群进行研究。从海葵的表面和匀浆液中分离到60株异养菌株,采用16SrRNA基因序列分析和部分生理生化试验,确定其中56株菌的种属情况。另外,对该类菌株所产胞外酶的情况以及与弧菌的拮抗情况进行测定。结果表明:这些可培养菌株的群落结构多样性较为丰富,其中的16株菌为假交替单胞菌属及其相关类群;其他菌株主要分布在其他19个属中。其中,17株菌可产胞外蛋白水解酶;20株菌可产胞外脂肪酶;菌株NQ8对一些弧菌具有较强的拮抗作用。     

两个不同发酵时期豆瓣中微生物多样性的差异对比

为了探明传统自然发酵豆瓣不同时期微生物的多样性的差异对豆瓣风味品质的影响,采用纯培养的分离方法,对发酵中期（5个月）时期和成熟期（10个月）豆瓣进行了细菌16SrRNA和真菌18SrRNA的基因分析。结果表明,这两个时期豆瓣中的微生物种类丰富,且差异很大。从发酵五个月的豆瓣中分离得到7个属（Bacillus、Oceanobacillus、Virgibacillus、Lactobacillus、Pichia、Candida、Wickerhamomyces）,优势菌为Bacillus、Candida、Wickerhamomyces属,分别占54%、11%、14%。成熟期中分离得到8个属（Bacillus、Halomonas、Oceanobacillus、Virgibacillus、Lactobacillus、Gracilibacillus、Pichia、Aspergillus属）,优势菌为Bacillus、Oceanobacillus、Halo-mona属,分别占55%、16%、10%。     

稻花香包包曲白酒发酵过程微生物动态分析

在稻花香白酒酿造过程中,大曲中微生物的形成和变化影响物质及能量的代谢途径,一定程度上也决定了稻花香白酒中特殊微生物菌群的形成。用传统鉴定方法结合DGGE、克隆分析等现代分子生物学方法研究了稻花香大曲中微生物群的动态变化及其主要微生物,结果显示,稻花香包包曲中原核微生物较丰富,优势种群主要包括细菌和放线菌,其中细菌占绝大部分,以芽孢杆菌、杆菌、球菌为主,原核微生物菌落结构随白酒发酵过程而发生改变。真核微生物优势种群主要包括酵母菌和霉菌,两者的多样性较丰富,霉菌以曲霉为主,群落结构和优势种群呈一定动态规律性的变化。     

烟草BELL基因家族鉴定及其温室条件下的表达模式分析

BELL基因是植物中普遍存在的一类基因,其编码的同源异型结构域转录因子参与调控了植物叶片、花序等多个组织的发育过程。为明确烟草BELL基因的结构和功能,通过同源序列比对和功能域分析鉴定了普通烟草BELL基因,结合系统进化和基因表达模式分析对烟草BELL基因的功能进行了初步预测。结果表明,从普通烟草基因组中共鉴定出28个NtBELLs基因,分布于15条不同的染色体上。系统进化分析表明,烟草NtBELLs基因可分为4组,每组参与调控烟草不同的发育过程。NtBELLs基因在6个烟草组织中呈现不同的表达模式,且具有明显的组织特异性。干旱和盐胁迫能显著诱导部分NtBELLs基因的表达,表明该基因家族可能参与了植物抵御非生物胁迫的过程。     

16S rDNA克隆文库法分析小龙虾肠道细菌多样性

利用16S rDNA克隆文库法对小龙虾肠道共生细菌进行系统发育分析。采用细菌16S rDNA通用引物以小龙虾全肠DNA为模板扩增共生细菌的16S rDNA并建立基因文库,对得到的基因序列进行系统发育分析。结果表明,从小龙虾肠道共得到24个不同的16S rDNA序列,系统发育分析表明这24个16S rDNA序列代表的克隆分别与柠檬酸杆菌属、拟杆菌属、梭菌属、Anaerorhabdus furcosa、Haloplasma、希瓦菌属、巨型球菌属、中慢生根瘤菌属、Brachymonas、Sinanaerobacter、Cyanobium、丹毒丝菌属菌株的16S rDNA序列最为接近,相似性为83.6%～99.4%。小龙虾肠道内细菌资源丰富,且肠道细菌在小龙虾食物消化过程中发挥一定作用,而16S rDNA克隆文库法在反映小龙虾肠道中主要微生物的物种组成,特别是样本中优势微生物类群上具有一定优势。     

鸟类宿主对西尼罗河病毒传播能力的种间差异性及影响因素

宿主物种对特定病原的传播能力通常具有明显的种间差异性. 研究表明,物种的一些生活史特征和其病原传播能力表现出显著的相关性. 本研究以虫媒传播型的西尼罗河病毒为例,通过文献检索系统收集了37种鸟类的病原传播能力指数,运用一般线性模型及系统发育比较法,分析了病原传播能力和3种生活史特征(体重、窝卵数及孵化时间)间的关系. 一般线性模型和系统发育比较法的结果均表明,宿主物种的3种生活史特征和其病原传播能力间均无显著相关关系; 但系统发育比较分析发现,病原传播能力表现出显著的系统发育信号,表明宿主间的亲缘关系能够在一定程度上解释病原传播能力的种间差异性.