科学家发现可用于水源水处理的新型细菌

<正>6月3日,哈尔滨工业大学发布信息称,该校市政学院李伟光教授课题组采用低温筛选方法,发现了可在2℃低温下生长的1株新型异养硝化细菌。根据国际命名法则,这一新菌种正式定名为"哈尔滨不动细菌"。该发现对于低温水源水氨氮处理新技术的开发具有重要理论意义和实用价值。该研究成果于今年5月在国际着名期刊《国际系统与进化微生物学杂志》正式发表。李伟光课题组对该菌的形态特征、生理生化特征、酶学特征及分子生物学特征等做了系统分析鉴定,将该菌株的基因序列与不动杆菌属内已     

高抑制金黄色葡萄球菌活性放线菌的分离及分子鉴定

从医院土壤中筛选分离代谢物具有较高抑制金黄色葡萄球菌活性的放线菌,并对其进行分子鉴定.结果得出,采用影印平皿法,以金黄色葡萄球菌为指示菌进行放线菌的分离,通过16S rDNA序列分析进行鉴定.结果得出,A01菌株发酵液对金黄色葡萄球菌抑制效果较好,与Streptomyces sp.VTTE-042674亲缘关系最近,达到99.86%,应属于链霉菌属.该菌株的16S rDNA序列已被GenBank收录,序列登录号为 HQ660584.     

嗜水气单胞菌拮抗芽孢杆菌抗菌素相关基因分析

分别对抗鲟源嗜水气单胞菌的解淀粉芽孢杆菌G1的抗菌素相关基因进行PCR扩增与测序,并对其编码产物的氨基酸序列、跨膜螺旋信号、结构域与二级结构等进行预测与分析。结果表明:菌株G1仅含有伊枯草菌素合成必需基因,该基因与GenBank基因库中芽孢杆菌属其他细菌的伊枯草菌素A、杆菌抗霉素D、抗霉枯草菌素等伊枯草菌素家族基因自然聚类,与枯草芽孢杆菌MH25株和RB14株的伊枯草菌素A基因16S rRNA序列有98%的高度同源性,而且其编码产物的氨基酸序列与GenBank中芽孢杆菌属其他细菌的伊枯草菌素、伊枯草菌素A、脂肽类化合物Bacillorin、芽孢菌素D等抗菌物质的氨基酸序列有高度同源性,与枯草芽孢杆菌MH25的伊枯草菌素A合成酶B(GenBank登录号:ABY89499)的亲缘关系最近。此外,菌株G1伊枯草菌素合成必需基因的编码产物不具有明显的跨膜结构,但其结构域中存在AMP结合位点和PP结合位点,二级结构中存在α螺旋、伸展链、β转角和无规则卷曲。     

东营凹陷中央隆起带地温场建立及地热系统发育模式

针对断陷盆地中央隆起带地热能开发地温场建立难度大的实际,采用井筒测温法、SiO2地热温标、钾镁地热温标、钠钾地热温标等建立地温场,研究地温场分布的控制因素,建立地温场发育模式。结果表明,东营凹陷中央隆起带沙二段—第四系可以划分为地表变温带、第一增温带、第一保温带、第二增温带、第二保温带、第三增温带和第三保温带共7个温度带。采用SiO2、钾镁、钠钾地热温标等方法求取了地温。综合研究区内地层对比、构造、储层、测井等地质研究成果,利用测温及化验资料,垂向上划分了6个砂组,建立了地温场的地质模型。地温梯度变化主要受中央隆起带底部塑性物质、主断裂分布、岩性、地层层位、砂地比控制。根据中央隆起带的地热成因及发育特征、温度及产水量,建立了该区的地热系统发育模式,划分为热扩张带、高温裂隙带、高温致密带、中温致密带、中温热水带、低温热水带和封盖带7层结构,从热源、盖层、热储层、热流通道、封闭性几方面分析了地热系统发育成因。     

A new strain Leptospirillum ferriphilum YTW315 for bioleaching of metal sulfides ores

A new strain named YTW315 was isolated from Dexing area using the double-layer culture technique. The morphological, biochemical and physiological characteristics of YTW315 were studied. Physiological investigation indicates that the strain YTW315 is a strict (obligate) chemolithoautotroph, metabolizing ferrous iron and pyrite. The optimal growth conditions for the strain are 40 ℃ and pH 1.6. A phylogenetic analysis based on 16S rRNA sequences shows that the isolate is clustered to Leptospirillum ferriphilum with 99.8% similarity to Leptospirillum ferriphilum strain Fairview and ATCC 49881. The molar fraction of DNA (G+C) of the isolate is 58.1%. The strain can tolerate high concentration of Fe(Ⅲ) and As(V) (500 mmol/L and 50 mmol/L, respectively). Bioleaching experiment indicates that the strain can oxidize Fe(Ⅱ) efficiently, and after 30 d, 44.56% of copper and 95.31% of iron are extracted from chalcopyrite and pyrite, respectively.     

川西高原牧区牦牛酸乳中的几株乳杆菌发酵特性及系统发育研究

通过感官评定和酸度测定,从川西高原自然发酵牦牛奶酸乳中分离的109 株乳酸菌中筛选出6 株发酵酸乳感官品质良好的乳杆菌,进一步研究这6 株乳杆菌的生长曲线、产酸特性、产黏特性、产乙醛特性,并采用16SrDNA 基因序列分析,初步研究其系统发育关系。结果表明：在42℃条件下,6 株乳杆菌在MRS 培养基中培养14h、在10% 的脱脂乳中培养8h 时,达到最高生长量;6 株乳杆菌发酵10% 脱脂乳凝乳时酸度都达到GB2746 -1999 的要求,凝乳黏度为1050～4900mPa·s,乙醛产量为15.11～26.64μg/mL。冷藏中菌株E1、E-5 产酸量小,后酸化能力弱。6 株乳杆菌单株凝乳冷藏中黏度在第5 天达最高,其中菌株E-1、E-5 的凝乳黏度变化小;菌株J-2、E-5 发酵乳冷藏乙醛含量在第3 天达到最高,其余菌株在第2 天达到最高。16S rDNA 基因序列的相似性分析表明,菌株4-7、E-1、E-5 之间的相似度达到99% 以上,这些菌株在系统发育树上与植物乳杆菌(L. plantarum)处于发育树的同一分支;菌株J-2 与副干酪乳杆菌(L.paracasei)处于发育树的同一分支,与代表菌株L.paracasei SM63 的相似度为97.6%;菌株4-1 和B-2 的相似度达到99%,与发酵乳杆菌(L.fermentum)处于发育树的同一分支。综合研究结果表明菌株E-1 和E-5 可用于开发酸乳发酵剂菌种。     

利用16S rDNA序列分析鉴定一株产抗菌物质的微生物菌株

从桃子上分离纯化得到1株产抗菌物质的菌株,命名为fmb3菌,通过抑菌实验发现该菌对革兰氏阳性菌蜡样芽孢杆菌、革兰氏阴性菌大肠埃希菌和真菌扩展青霉等3种常见食品病原菌具有显著的抑菌效果。利用16SrDNA分析对该菌作了系统进化鉴定,首先提取fmb3菌基因组DNA,根据不同种属的细菌的16SrDNA序列两端的保守性设计通用引物,对fmb3菌16SrDNA片断进行PCR扩增,对扩增得到的目标片段测序,并且利用NCBIBLAST对测序结果进行比对,构建系统进化树进行分析,初步确定该菌属于枯草芽孢杆菌。     

神农架地区酒曲驯养酵母的多样性与特性研究

神农架地区有着悠久的酿酒历史,酿酒酵母的生物多样性丰富。通过收集神农架及周边地区酿酒作坊的9种不同的酒曲,从中分离获得19株酵母菌,通过形态学观察,产子囊孢子情况及抗逆性能探究,并根据对其rDNA-ITS序列构建的系统发育树进行分析。结果表明,此19株驯养酵母菌可归为5个属,分别为Wickerhamomyces sp.,Pichia sp.,Saccharomyces sp.,Saccharomycopsis sp.和Candida sp.。从酒曲中分离出来的Wickerhamomyces sp.有8株,占菌种总数的42.1%,Saccharomyces sp.有6株,占总数的31.6%,均为优势菌株。     

源自硫化矿区的氧化亚铁硫杆菌新菌系的鉴定

从广西铜坑矿区多金属复杂硫化矿矿坑水中分离得到了一株嗜酸氧化亚铁硫杆菌(暂命名为TK),该菌株为革兰氏阴性细菌,短杆状,菌体大小为(0.4±0.1)μm×(1.4±0.2)μm,最适生长温度为25~30℃,最适pH值为2.0,化能自养型,能利用亚铁、单质硫和葡萄糖生长,不能利用硫代硫酸钠、蛋白胨生长。测定其亚铁和元素硫的氧化能力,并考察它对铁闪锌矿的浸出效果。以16SrDNA序列同源性为基础构建了包括15株已报道菌种和其他菌属菌株作为外来群在内的系统发育树。结果表明:TK菌株处于单独的一个分支内,与嗜酸氧化亚铁硫杆菌株D2最为相似,相似性为98.67%,推测TK菌株为嗜酸氧化亚铁硫杆菌的一个新菌系。该菌系的分离为嗜酸氧化亚铁硫杆菌多样性和生态分布研究提供了一种新材料。     

生物系统发育形态演变的周期性和个体发育的预演现象

列举了一系列实例,说明生物系统发育形态演变的周期性,讨论了形态演变周期性的实质。个体发育形态变化系列,有时与其后来的系统发育演化系列相似,预示着后来的系统发育的演化趋向,本文把这种现象称谓预演现象。依据生物系统发育形态演化的周期性,可以解释个体发育的预演现象。