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利用GBS技术开发烟草SNP标记及遗传多样性分析 总被引:1,自引:0,他引:1
研究烟草种质资源的遗传背景,为烟草种质资源的高效利用提供依据。采用GBS (genotyping-by-sequencing)技术,挖掘92份烟草种质资源的SNP位点,并进行遗传多样性和遗传结构分析。结果表明,测序共获得了147.165 Gb数据,平均每个样本1.599 Gb,筛选后共获得93 685个高质量的SNP位点;不同地理来源烟草群体等位基因数(Na)为1.27~1.93,观测杂合度(Ho)变化范围为0.22~0.76,期望杂合度(He)为0.32~0.59,多态性位点数(PLN)范围为15 877~44 249,多态性位点比率(PPL)为26.61%~74.17%,遗传多样性指数(H)为0.19~0.52,遗传距离(GD)为-0.0148~0.3849。基于遗传距离的NJ聚类将材料划分为两个类群;群体遗传结构分析表明,本研究所用材料基于模型可划分为4个亚群。通过GBS技术得到的测序数据量较大且质量较高,群体多态性较高,整体遗传多样性偏低,群体结构划分与种质来源不完全相关。 相似文献
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运用地统计学方法,研究了蒙顶山茶同土壤钾素在不同尺度下的空间变异特征.结果表明:两个尺度下蒙顶山土壤全钾和速效钾含最均具有中等空间相关性.(1)小尺度下土壤全钾和速效钾的C0/(C0 C)值分别为43.3%和27.2%,二者的变异方向略有不同,但均表现出在顺坡方向变异明显,在横坡方向变异较弱,土壤全钾和速效钾均呈片状分布,且均有东北区高于西南区的趋势;(2)微尺度下土壤全钾和速效钾也具有中等空间相关性,C0/(C0 C)值分别为47.9%和59.8%,表明在微域范围内随机性因子对其空间变异的影响大于小尺度.土壤全钾在东偏南和垂直方向变异最明显,速效钾除在东北方向以及接近坡面水平方向有一定的变异外,在其它方向的变异都不明显,全钾和速效钾均在斜坡方向出现规律性的带状分布. 相似文献
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植物所处环境条件会影响植物根系分泌物的数量和组成,同时,植物根系分泌物也会影响根际环境条件。本文综述了植物种类(品种、生长发育阶段)和光温水、养分胁迫、重金属胁迫、微生物活动等环境条件对植物根系分泌物的影响;植物根系分泌物对根际微区土壤结构性、pH、CEC、养分活化和微生物区系等方面的影响,并提出了今后植物根系分泌物与环境条件研究中在研究方法、不同环境条件等方面值得关注的问题。 相似文献
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对紫色土施用单质硫条件下大蒜生长发育及硫素营养吸收和代谢进行了研究。结果表明,大蒜株高、叶面积、经济产量(蒜头)和经济系数以中等供硫水平最高,而茎粗和生物产量则以高硫水平最大。大蒜能耐高浓度的硫素供应,在0~120kghm-2供硫情况下,其全硫(TS)、水溶性硫(SS)和无机硫(Io-S)含量均随供硫量的增加而上升,小分子水溶性含硫氨基酸含量(Ws-S)以低硫水平最高,而大分子蛋白质硫含量(Wis-S)以中等供硫水平时最高,与大蒜素含量的变化一致。大蒜素含量与不同硫组分比率的关系分析发现,大蒜素含量与Ws-S/TS呈极显著的正相关(r=0.752 ),与Io-S/SS呈显著的正相关(r=0.702 )。全氮含量与全硫含量变化趋势一致,全磷含量以低硫水平时最高,全钾含量以中等供硫水平时最高。 相似文献