基于SNaPshot技术对ABO血型亚型分型的方法

ABO亚型会导致红细胞凝集反应出现正反定型不符,目前实验室针对ABO亚型的鉴定主要使用PCR-SSP,该技术存在假阳性、通量低等缺点,因此开发可准确鉴定ABO血型亚型的方法迫在眉睫.为解决该问题,作者构建了一种基于SNaPshot技术鉴定ABO血型亚型的方法,该方法通过检测ABO基因第六外显子(261、297)、第七外显子(425、467、695、700、803、871、1054)上的9个SNP位点,并根据它们的组合鉴别14种不同的ABO等位基因.作者还提取50个外周血样本的基因组DNA,运用SNaPshot技术成功地对所有样本进行分型,共检出10种等位基因,分别为A101、A102、B01、B305、BW11、O101、O102、O02、B(A)02和CisAB.经验证,该方法适用于ABO血型亚型的分型.     

基于RPA-LFD法的多黏菌素耐药基因mcr-1可视化快速检测方法建立与应用

目的：建立一种快速、高效、可视化的细菌多黏菌素耐药基因mcr-1检测方法，为其基层检测的展开提供依据和便利。方法：利用重组酶聚合酶扩增结合胶体金侧向流试纸条技术(Recombinase polymerase amplification combined with a lateral flow dipstick,RPA-LFD)，辅以手持式胶体金读数仪；根据mcr-1基因保守序列设计合成一对特异性RPA引物，通过对反应条件和体系的优化，以及特异性试验、灵敏度试验、模拟食样试验和实际样品试验，成功建立了可视化定量检测细菌多黏菌素耐药基因mcr-1的RPA-LFD方法。结果：在引物浓度400 nmol/L，引物比例1:1时，该方法最佳反应条件为Mg²⁺浓度14.0 mmol/L，反应温度37℃，反应时间20 min；灵敏度好，标准曲线方程为y=0.117x+0.051，定量限为10¹～10⁸ copies/μL，检出限为10¹ copies/μL，比PCR法低一个数量级且模拟样品检出结果与PCR法一致。利...     

乌龙茶加工过程中α-法呢烯的形成关键调控基因的筛选与表达分析

为探讨乌龙茶加工过程中做青工序的机械力对香气成分中α-法呢烯的影响及形成机理,本实验以乌龙茶品种黄旦的鲜叶、萎凋叶、摇青叶为供试材料,未摇青等时间摊放叶为对照组,采用GC-TOF-MS 方法检测乌龙茶加工过程中α-法呢烯含量,结合转录组和茶树基因组数据库筛选α-法呢烯合成酶(AFS)关键基因,构建系统进化发育树,利用实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)进行数据验证,并进行α-法呢烯含量与基因表达水平间的相关性分析。结果表明,α-法呢烯的含量在第一次摇青时有所下降,由于机械胁迫的累加,摇青叶中α-法呢烯的含量逐渐增加并在第三次摇青时达到峰值(0.9485%)。筛选获得的CL11384.Contig7_All转录本与茶树α-法呢烯合成酶基因(CsAFS,GenBank登录号:MH125264.1)高度相似,暂命名为CsAFS7基因,该基因表达模式与测序数据相一致。皮尔逊相关系数分析表明,乌龙茶加工过程中α-法呢烯含量与CsAFS7基因的相关表达水平之间存在极显著正相关(r=0.951,P<0.01)。因此,乌龙茶做青过程中α-法呢烯的累积可能受到CsAFS7基因的表达调控。     

分时电价下多目标绿色可重入混合流水车间调度

针对多目标绿色可重入混合流水车间调度问题（RHFSP）的特点，在机器分配和工序排序的基础上引入分时电价机制，构建了以最小化最大完工时间、总能耗成本和碳排放为目标的绿色调度优化模型，提出了一种改进的多目标文化基因算法（MOMA）来求解该问题，通过数值实验验证了所设计的MOMA算法的可行性。实验结果表明MOMA算法在非劣解的收敛性、多样性和支配性指标方面都显著优于多目标蚁狮优化算法(MOALO)、多目标粒子群优化算法（MOPSO）和带精英策略的非支配排序遗传算法（NSGA-Ⅱ），四种算法的分布性指标无显著差异。所提出的模型能够使企业有效避开高电价时段作业，合理转移用电负荷，达到降低总用电成本和碳排放的目的。     

CYP2D6基因多态性对托烷司琼预防化疗所致恶心呕吐效果的影响

肿瘤对人类健康造成很大威胁。化疗作为一种全身性的治疗方法，在肿瘤治疗中的地位不可动摇。化疗所致恶心呕吐（chemotherapy induced nausea and vomiting, CINV）是化疗过程中常见的不良反应，严重影响了患者的情绪、生活质量和肿瘤的控制。CINV的防治对肿瘤患者来说非常重要。托烷司琼是较常用的5-羟色胺Ⅲ亚型（5-hydroxytryptamine type 3, 5-HT3）受体拮抗剂，在防治CINV方面具有很好的临床效果，但仍有部分患者使用托烷司琼后效果不佳。越来越多的研究表明这些个体差异可能与基因多态性密切相关。本文就细胞色素P450 2D6（cytochrome P450 2D6, CYP2D6）基因多态性对托烷司琼预防CINV效果的影响作一综述，以期为基因多态性指导下的临床个体化用药提供思路。     

pazopanib血药浓度个体差异与细胞色素P450 3A4基因多态性的关系初探

目的：分析健康受试者口服pazopanib片后体内药代动力学（PK）规律，初步探讨pazopanib片PK个体差异的遗传学机制。方法：14例健康男性受试者分别在给药当天单次口服pazopanib片（200 mg）后，采集基线至96 h血液样本，用LC-MS/MS法测定服药后各时间点血药浓度，用WinNonlin 6.3软件计算药代动力学相关参数，采用SNapShot法测定细胞色素P450 3A4（CYP3A4）基因多态性。结果：Cmax变化范围（7 361.65-26 081.00） ng/mL，平均值±标准差（15 410.72±6 366.21） ng/mL ；tmax变化范围（1.50-4.00） h、平均值±标准差（2.50±0.83） h；AUC0-t变化范围（228 013.55-775 231.63）ng·mL-1·h，平均值±标准差（516 279.90±175 688.41）ng·mL-1·h。个体间Cmax、AUC相差达3倍以上，tmax可相差2倍以上；14例受试者CYP3A4（RS35599367）位点皆为野生型。结论：pazopanib片在中国健康男性志愿者中个体差异较大，未观察到CYP3A4（rs35599367）位点单核苷酸多态性，pazopanib个体间PK差异可能与其他药物代谢相关基因多态性有关。     

维吾尔族人群LPL基因PvuⅡ多态性与身体测量和血生化指标的相关性研究

目的探讨脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,LPL)基因PvuⅡ酶切位点多态性在塔克拉玛干沙漠腹地健康维吾尔族人群中的分布特征及其与身体测量和血生化指标的相关性,并与不同种族人群进行比较。方法采用PCR-RFLP方法检测99例健康维吾尔族人群(男性38例,女性61例)LPL基因PvuⅡ酶切位点的多态性。结果新疆99例健康维吾尔族人群中以P+等位基因多见,频率(52.02%)高于P-等位基因频率(47.98%),三种基因型中以P+P-基因型最为多见(61.62%),其次为P+P+基因型(21.21%),最低是P-P-基因型(17.17%),且各基因型和等位基因频率在男女中分布无显著性差异(P>0.05);男性中P-P-基因型组空腹血糖水平显著高于P+P+和P+P-基因型组,各基因型与空腹血糖有显著性差异(χ~2=3.411,P<0.05),在女性中P-P-基因型组总胆固醇水平显著高于P+P-和P+P+基因型组,各基因型与总胆固醇有显著性差异(χ~2=4.669,P<0.05),其他各项身体测量和生化指标均未见显著性差异(P>0.05);而LPL基因PvuⅡ酶切位点多态性在维吾尔族人群中的分布与海南汉族人群、大连汉族人群、郑州汉族人群、海南黎族人群等不同民族人群比较均存在显著差异(P<0.01,P<0.05);与日本、中国汉族、韩国、阿拉伯、土耳其等不同种族人群比较也均存在显著差异(P<0.01,P<0.05),而与芬兰和印度人群比较的差异无显著性(P>0.05)。结论 LPL基因PvuⅡ酶切位点P-P-基因型和P+等位基因在健康维吾尔族人群中的分布可能与空腹血糖、总胆固醇等血脂水平相关联。     

创新畅想

敲除病虫害基因让棉花高产又"绿色"近日,华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室棉花团队传来喜讯,该团队在棉花基因编辑系统研究方面取得系列突破,通过实施精准打靶,他们的新系统能成功敲除棉花基因中的"奸细",为高品质棉花生产保驾护航。"在棉花基因编辑领域,我们处于国际领先地位。"团队教授金双侠说,目前团队已研发出4套棉花基因编辑系统,在全球广泛应用。早在2013年,团队尝试将水稻、拟南芥的CRISPR编辑体系引入棉花,没有获得成功。后经不断尝试,团队根据棉花的生物学特性,把调控元件改为棉花自身元件,第一套棉花基因编辑系统于2017年创建,编辑效率达85%。科研攻关持续进行,棉花基因编辑系统第二套、第三套和第四套相继成功。脱靶效应测试证明,团队创建的基因编辑系统精准度高、脱靶率极低。     

DRD2和5-HTR2A基因多态性及其交互作用对奥氮平治疗精神分裂症疗效的影响

目的：探讨多巴胺D2受体（dopamine D2 receptor, DRD2）和5-羟色胺2A受体（5-hydroxytryptamine 2A receptor, 5-HTR2A）基因多态性及其交互作用与奥氮平治疗精神分裂症疗效的关系。方法：纳入147例接受单一奥氮平治疗的精神分裂症住院患者为研究对象，采用阳性与阴性症状量表（PANSS）评定药物疗效，按PANSS减分率≥50%和<50%，分为有效组和无效组。采用多重高温连接酶检测反应技术（iMLDR）检测DRD2（rs1799978、rs1800497）和5-HTR2A（rs6311、rs6313）基因多态性；采用多因素Logistic回归分析各基因型和奥氮平疗效的关联性，采用多因子降维法（MDR）分析基因-基因的交互作用。结果：有效组和无效组rs1799978、rs6313位点基因型和等位基因频率分布差异均有统计学意义（P<0.05），而两组rs1800497、rs6311位点基因型和等位基因频率分布差异均无统计学意义（P>0.05）；rs1799978位点GA和GG型患者奥氮平疗效较野生AA型好，其比值比（OR）及95%CI分别为5.101（1.118～23.267）、6.051（2.454～14.925）；rs6313位点CT和CC型患者奥氮平疗效较野生TT型好，其OR及95%CI分别为2.623（1.054～6.528）、3.412（1.180～9.869）；rs1799978、rs1800497和rs6313位点间存在交互作用，其交互模型为最优基因-基因交互作用模型（P<0.05），该模型检验样本准确度为0.727 3，交叉验证一致性为10/10。结论：DRD2（rs1799978）和5-HTR2A（rs6313）基因多态性可能与奥氮平治疗精神分裂症疗效相关，DRD2（rs1799978、rs1800497）和5-HTR2A（rs6313）对奥氮平疗效的影响存在交互作用。