利用高通量测序技术分析传统面引子中的酵母菌多样性

面引子是传统面食加工中发酵剂,酵母菌是面引子中的重要微生物之一,对其研究大多集中于传统分离培养法,文章旨在采用新一代高通量测序技术揭示传统面引子中的酵母菌群落结构特征。从我国吉林省、山东省、山西省、陕西省、甘肃省以及河南省收集18个面引子样品,基于宏基因组采用PCR扩增ITS1区,Illumina Miseq测序,云平台分析样品中酵母菌群落。结果表明样品中共有12个属16种酵母菌,分别是酿酒酵母、Kazachstania bulderi、异常威克汉姆酵母、光滑假丝酵母、矮小假丝酵母、清酒假丝酵母、近平滑假丝酵母、戴尔凯氏有孢圆酵母、扣囊复膜孢酵母、马克思克鲁维氏酵母、发酵毕赤酵母、Meyerozyma guilliermondii、Trichomonascus ciferrii、Hyphopichia burtonii,未鉴定出的假丝酵母和未鉴定出的酵母。其中酿酒酵母是大多数样品中的优势菌,而Kazachstania bulderi、光滑假丝酵母菌、矮小假丝酵母、清酒假丝酵母、戴尔凯氏有孢圆酵母、异常威克汉姆酵母在少数样品中也有较高的分布。各样品酵母菌群落结构相差不大,而且在类型和地理分布差异也不明显。     

鱿鱼丝加工中真菌菌相变化规律及优势真菌的分离鉴定

为减少鱿鱼丝加工过程中真菌污染,提高鱿鱼丝产品的质量,将传统的微生物鉴定技术与5.8S r DNA-ITS序列分析法相结合,并通过系统发育树分析,探索鱿鱼丝加工过程中真菌菌相变化规律及优势菌株。结果表明,在鱿鱼丝加工过程中,不同阶段样品中真菌数量差异显著(p0.05),在加工终点(即烘干包装后)时真菌数量高达2.61 log cfu/g,其中调味和烘干包装阶段是真菌污染的主要环节。加工终点的鱿鱼丝中分离出6种酵母菌和4种霉菌,经测序并通过National Center for Biotechnology Information(NCBI)数据库比对,确定它们分别属于假丝酵母属(Candida sp.)、隐球酵母属(Cryptococcus sp.)、座囊菌属(Dothideomycetes sp.)、胶红酵母属(Rhodotorula sp.)、丝孢酵母属(Trichosporon sp.)、茎点霉属(Phoma sp.)、青霉属(Penicillium sp.)、曲霉属(Aspergillus sp.)、枝孢霉属(Cladosporium sp.)。其中,青霉菌(M-03)和假丝酵母菌(Y-04)为鱿鱼丝加工过程中的优势菌,在加工终点时的数量分别为1.85 log cfu/g和2.15 log cfu/g。     

牛栏山二锅头酿造过程中的真菌多样性分析

[目的]分析牛栏山二锅头大茬酒醅发酵过程中真菌群落结构及多样性,确定发酵过程中优势真菌,为解析牛栏山二锅头的形成过程提供理论支撑。[方法]将传统可培养分离方法和高通量测序技术相结合,对牛栏山二锅头大茬酒醅发酵过程真菌进行多样性分析。[结果]采用传统分离方法从大茬酒醅中分离获得559株真菌,共分为13个不同的类群,主要为扣囊覆膜酵母、酿酒酵母、伞枝横梗霉。根据微生物数量变化确定大茬酒醅真菌演替规律,即扣囊覆膜酵母和伞枝横梗霉是发酵初期的主要真菌,以毕赤酵母为主的生香酵母和酿酒酵母在发酵前期快速增长;在顶火期,除酿酒酵母以外的真菌已无法分离到,酿酒酵母成为顶火期和发酵后期的主体真菌。高通量测序中共获得143种真菌OTU,主要包括酵母目、毛霉目、散囊菌目和丝孢酵母目,其中扣囊覆膜酵母是发酵前期的主要真菌,酿酒酵母是中期和后期的主要真菌。[结论]大茬发酵过程中真菌多样性丰富,两种分析手段结果较为一致,确定了大茬酿造过程中主要真菌为扣囊覆膜酵母、伞枝横梗霉和酿酒酵母。     

再造烟叶生产过程物料微生物群落结构分析

为分析造纸法再造烟叶生产过程微生物的多样性及其分布与变化情况,以再造烟叶生产过程各物料为研究对象,采用Illumina高通量测序技术对25个物料样品的细菌16S rRNA V3-V4区和真菌ITS序列进行测序分析,获得了生产过程物料细菌和真菌丰度及群落组成情况。结果表明:①再造烟叶生产过程物料中共检测出393个细菌属和165个真菌属,其中优势菌属为乳杆菌属（Lactobacillus）、芽孢杆菌属（Bacillus）、假丝酵母属（Candida）和曲霉属（Aspergillus）;②生产过程不同物料微生物群落多样性和结构存在明显差异,聚类分析显示细菌属多样性和结构变化相对较小而真菌属变化相对较大;③从萃取到制涂布液过程中,细菌乳杆菌属（Lactobacillus）相对丰度逐渐增加,而真菌假丝酵母属（Candida）相对丰度总体逐渐降低。      

内蒙古传统发酵驼乳中乳酸菌和酵母菌的分离鉴定及其生物多样性分析

采用传统培养方法对4份内蒙古阿拉善盟传统发酵驼乳样品中的乳酸菌和酵母菌进行分离纯化,运用16S rRNA基因序列分析方法进行种属鉴定,同时采用Pac Bio SMRT三代测序技术对样品中的细菌和真菌多样性进行研究。发酵驼乳中共分离到8株乳酸菌和5株酵母菌,乳酸菌包括1株胚芽乳杆菌、2株瑞士乳杆菌、2株嗜热链球菌、2株假肠膜明串珠菌和1株开菲尔基质乳杆菌。酵母菌包括1株马克斯克鲁维酵母、2株酿酒酵母、1株诞沫假丝酵母和1株芽殖酵母。Pac Bio SMRT测序结果显示,硬壁菌门为4份发酵驼乳样品中的优势细菌门,乳杆菌属为优势细菌属,以及瑞士乳杆菌为优势细菌种;子囊菌门为发酵驼乳样品中的优势真菌门,克鲁维酵母菌属为优势真菌属以及马克斯克鲁维酵母为优势真菌种。     

传统清香型白酒发酵过程中真菌群落结构及其动态演替

通过Illumina MiSeq高通量测序技术,对传统清香型白酒大楂和二楂发酵过程中的真菌群落结构、丰度及演替规律进行研究,测序获得有效序列数分别为488 956条和642 670条,分别包含14 230个和7 303个OTU,归类为26个亚门或纲,主要为子囊菌纲、担子菌亚门、接合菌亚门和其它未分类的单元。结果表明,传统清香型白酒大楂和二楂真菌群落组成丰富,在发酵过程中真菌的种类和数量随着发酵时间的延长和环境的改变而不断变化,其中子囊菌纲的腹膜孢酵母属、酵母属、假丝酵母属、有孢汉逊酵母属和有孢圆酵母属为传统清香型白酒大楂或二楂发酵主要优势菌群。本研究为清香型白酒发酵过程中功能性微生物菌群的进一步挖掘奠定了基础。     

基于高通量测序和可培养方法的勐海发酵普洱茶真菌多样性分析

通过高通量测序技术和传统可培养方法跟踪分析了勐海百中堂茶厂普洱茶发酵过程不同阶段的真菌多样性,采用多相鉴定方法准确鉴定了可培养真菌的分类学地位。可培养方法共分离到真菌107株,包括11个属,16个种,优势种为琉球曲霉(Aspergillus luchuensis)、新黑曲霉(Aspergillus neoniger)、烟曲霉(Aspergillus fumigatus)、青霉(Penicillium sp.)、枝孢菌(Cladosporium sp.)、微小根毛霉(Rhizomucor pusillus)、伞枝横梗霉(Lichtheimia corymbifera)、食腺嘌呤芽生葡萄孢酵母(Blastobotrys adeninivorans)、法布里德巴利酵母(Debaryomyces fabryi)、布兰克假丝酵母(Candida blankii)。高通量测序共分析到真菌69个属,189个OTU,优势属包括枝孢菌属(Cladosporium)、芽生葡萄孢酵母属(Blastobotrys)、假丝酵母属(Candida)。结果显示,普洱茶发酵过程中前期真菌多样性较后期高,研究结果为发酵普洱茶微生物安全性评价及功能性分析奠定了基础。     

不同处理方式的大曲真菌群落差异分析

为探究热风干燥工艺对贮存期大曲中真菌群落的影响,采用实时荧光定量聚合酶链式反应和Illumina?MiSeq高通量测序技术分析和比较不同处理方式的大曲真菌群落的差异。结果表明不同处理方式大曲中的真菌18S?rRNA基因拷贝数在1×1011～4.5×1011?copies/g之间,ZR3拷贝数最大为4.5×1011?copies/g。不同处理大曲的优势真菌类群均为嗜热子囊菌属（Thermoascus）、根毛霉属（Rhizomucor）、曲霉菌属（Aspergillus）、假丝酵母属（Candida）。其中嗜热子囊菌属在大曲真菌群落中具有明显的优势,若要保持其优势,需提供曲库的贮存条件;实验室贮存环境相比于曲库更有利于曲霉菌属类的生长;干燥工艺后的环境更利于假丝酵母属类生长。大曲RG3（热风干燥处理的大曲在实验室条件下贮存2 个月）的多样性指数较高,真菌群落有较大的变化,差异性明显;其中耐盐真菌（Wallemia）、丝衣霉菌属（Byssochlamys）、青霉菌属（Penicillium）、曲霉菌属（Aspergillus）是RG3区别于其他大曲的主要真菌群类;同时主成分分析看出大曲RG3落点相对较远,此类大曲有进一步研究的价值,为大曲热风干燥工业化应用提供指导。     

内蒙古鄂尔多斯地区酸粥真菌多样性研究

以内蒙古鄂尔多斯地区的3种酸粥为研究对象,采用Illumina Miseq高通量测序技术与传统微生物学手段相结合的方法对其真菌多样性进行研究。结果表明,3种酸粥样品中存在着大量共有真菌菌群,其优势真菌主要由隶属于子囊菌门（Ascomycota）的假丝酵母属（Candida）和耐碱酵母属（Galactomyces）以及隶属于担子菌门（Basidiomycota）的毛孢子菌属（Trichosporon）构成,三者平均相对含量分别为84.30%、11.86%和3.45%;同时从3种酸粥样品中共分离出9株酵母菌,经分子生物学鉴定为茶叶籽酵母（Meyerozyma caribbica）、索拉尼假丝酵母（Candida solani）、库德毕赤酵母（Pichia kudriavzevii）、白地霉（Galactomyces candidum）、解脂耶氏酵母（Yarrowia lipolytica）和隐球酵母（Cryptococcus albidus）各1株以及近平滑假丝酵母（Candida parapsilosis）2株。     

大竹米酒真菌群落研究及酵母菌分离鉴定

以四川省达州市大竹地区的7份米酒样品为研究对象,采用MiSeq高通量测序技术对米酒样品中真菌菌群多样性进行分析,并通过传统微生物培养技术与分子生物学手段分离鉴定米酒样品中的酵母菌。米酒中真菌群落α多样性分析结果表明,该研究的测序条件可以有效反映样品中生物信息。真菌群落结构分析表明,子囊菌门（Ascomycota）(50.11%)和毛霉亚门（Mucoromycota）(49.81%)为米酒中的优势真菌门（平均相对含量≥1%）,根霉属（Rhizopus）(49.64%)、复膜孢酵母属（Saccharomycopsis）(19.93%)、酿酒酵母属（Saccharomyces）(16.58%)和威克汉姆酵母属（Wickerhamomyces）(11.53%)为米酒中的优势真菌属（平均相对含量≥1%）。操作分类单元（OTU）结果显示,米酒样品中含有13个核心OTU,占总序列数的86.35%,主要隶属于根霉属（49.48%）、复膜孢酵母属（19.61%）和酿酒酵母属（16.21%）。大竹米酒中可分离菌株以酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）为主,相对含量达87.5%。     

酸汤子面团对发酵面包品质的影响

以不同地区采集的酸汤子面团为研究对象，采用高通量测序技术测定其微生物多样性，并利用此酸汤子面团发酵面包制品，分析面团中主要菌属所占比例与面包品质的相关性。结果表明：在采集的11 种酸汤子面团中共鉴定出6 种乳酸菌属，分别为Lactobacillus、Leuconostoc、Lactococcus、uncultured Streptococcaceae、Pediococcus、Streptococcus，鉴于多数样品中检测出Lactobacillus，推测其为酸汤子样品细菌优势菌属；鉴定出7 种酵母菌属，分别为Candida、Pichia、Dipodasous、Zynosaccharomyces、Naumovozyma、Metschnikowia、Sugiyamaella，鉴于Candida、Pichia在多数样品中被检测出，推测其为酸汤子样品真菌优势菌属。酸汤子面团中乳酸菌和酵母菌总含量高，且酵母菌含量越高，则面包产品硬度、胶黏性、咀嚼性越低，贮藏期间硬度变化和水分变化越小，面包品质越好。     

Microbial diversity of traditional Vietnamese alcohol fermentation starters (banh men) as determined by PCR-mediated DGGE

The diversity of fungi and bacteria associated with traditional Vietnamese alcohol fermentation starters (banh men) was investigated by PCR-mediated DGGE. From 52 starter samples, 13 species of fungi (including yeasts) and 23 species of bacteria were identified. The fungal composition of the starters was consistent with little variation among samples. It consisted of amylase producers (Rhizopus oryzae, R. microsporus, Absidia corymbifera, Amylomyces sp., Saccharomycopsis fibuligera), ethanol producers (Saccharomyces cerevisiae, Issatchenkia sp., Pichia anomala, Candida tropicalis, P. ranongensis, Clavispora lusitaniae), and (opportunistic) contaminants (Xeromyces bisporus, Botryobasidium subcoronatum). The bacterial microflora of starters was highly variable in species composition and dominated by lactic acid bacteria (LAB). The most frequent LAB were Pediococcus pentosaceus, Lactobacillus plantarum, L. brevis, Weissella confusa, and W. paramesenteroides. Species of amylase-producing Bacillus (Bacillus subtilis, B. circulans, B. amyloliquefaciens, B. sporothermodurans), acetic acid bacteria (Acetobacter orientalis, A. pasteurianus), and plant pathogens/environment contaminants (Burkholderia ubonensis, Ralstonia solanacearum, Pelomonas puraquae) were also detected. Fungal DGGE was found to be useful for evaluating starter type and starter quality. Moreover, in view of the high biological diversity of these substrates, bacterial DGGE may be useful in determining the identity of a starter. The constant occurrence of opportunistic contaminants highlights the need for careful examination of the role of individual components in starters.     

基于高通量测序技术分析朝鲜族传统米酒及其酒曲中微生物群落多样性

以吉林延边朝鲜族地区酒曲及其发酵后粗滤和精滤米酒为研究对象,分别采用Illunina MiSeq、Illunina HiSeq高通量测序平台对朝鲜族传统米酒及其酒曲中细菌16S rDNA V3区和真菌ITST1区进行测序,分析其微生物群落结构多样性。结果表明,本次测序深度有效地覆盖其微生物种类,酒曲及米酒中细菌和真菌有丰富多样性;与酒曲相比,米酒中微生物群落结构存在显著差异,粗滤、精滤米酒间微生物群落结构具有一定相似性。在属水平下,酒曲和米酒样品中共鉴定出147 个细菌物种,酒曲中优势菌种为假单胞菌属（Pseudomonas）（5.00%）、肠杆菌属（Enterobacter）（4.28%）,2 种米酒中优势菌均为乳杆菌属（Lactobacillus）（粗滤米酒3.72%、精滤米酒7.73%）和肠杆菌属（粗滤米酒6.31%、精滤米酒4.41%）;在种水平下,真菌菌属共鉴定出12 个物种,酒曲中优势菌为普鲁蓝久浩酵母（Guehomyces pullulans）（10.22%）,2 种米酒中优势菌均为酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）（粗滤米酒49.48%、精滤米酒81.52%）和伯顿丝孢毕赤酵母（Hyphopichia burtonii）（粗滤米酒29.47%、精滤米酒6.43%）。     

基于高通量测序分析老面中菌群多样性及其对馒头品质的影响

以河北(HB)、山西(SX)、山东(SD)和云南(YN)的老面为研究对象,采用高通量测序技术分析4个不同地区老面的菌群组成,并探究菌群对馒头品质的影响。结果表明,4种老面样品中细菌多样性优于真菌多样性,真菌菌门中相对丰度较大的是担子菌门(Basidiomycota),细菌菌门中相对丰度较大的是厚壁菌门(Firmicutes)。在属水平上,HB、SX和SD样品中以片球菌属(Pediococcus)为主;而YN样品中以乳杆菌属(Lactobacillus)为主;老面中丰富的菌群可改善馒头的质构特性,使馒头内部结构更细腻柔软。     

不同原料组成对黏豆包酸面团的真菌菌群及流变学特性的影响

为探究原料组成对东北地区黏豆包酸面团中的真菌菌群构成及流变学特性的影响,收集东北地区手工制作的黏豆包酸面团16份并依据原料组成不同分为A(江米+大米)、B(江米+黏玉米)、C(黏玉米、黄米和大米)和D(黄米+黏玉米)四组,采用高通量测序技术结合聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳技术(PCR-DGGE)研究黏豆包酸面团中真菌菌群构成,并测定酸面团的流变学特性、pH和总滴定酸度(TTA)。结果显示:在属水平上,A和C组检出的菌属除共有菌属[微囊藻属(Cystofilobasidium)、隐球酵母菌(Cryptococcus)、德巴利氏酵母属(Debaryomyces)和丝孢酵母属(Trichosporon)]外,A组中还发现曲霉属(Aspergillus)、青霉属(Penicillium)、附球菌属(Epicoccum)、威克汉姆酵母属(Wickerhamomyces)和根霉属(Rhizopus),而C组中还发现汉逊氏酵母属(Hanseniaspora)。B组有隐球酵母属和德巴利氏酵母属;D组中仅含有汉逊氏酵母属。汉逊氏德巴利酵母(Dabaryomyces hansenii)为优势酵母。此外,添加玉米或黄米能提高酸面团的黏性和弹性。生酸面团的弹性模量、复合黏度与拟威尔酵母(Cyberlindnera)有显著正相关性(P<0.05),拟威尔酵母的发酵作用能增强酸面团的弹性。生酸面团的损耗因子与汉逊氏酵母属呈显著正相关(P<0.05),与隐球酵母菌及Naumovozyma呈显著负相关(P<0.05),即真菌可影响生酸面团的流体性质和固体性质;丝孢酵母属等真菌能加强熟酸面团的流体性质。pH与掷孢酵母属、汉纳酵母属和亚球壳属等真菌之间呈显著正相关(P<0.05),TTA值与微囊藻属、隐球酵母菌和青霉属等8个菌属呈显著负相关性(P<0.05),说明pH低和总酸度高的酸性环境抑制掷孢酵母属和微囊藻属等真菌的生长。因此,原料组成对黏豆包酸面团中真菌菌群构成有影响(江米和大米混合制备酸面团中酵母菌多样性最丰富),对酸面团的流变学特性也有一定的影响,且流变学特性、pH和TTA与酸面团中真菌有相关性。     

传统酸面团菌群结构及其酵制馒头风味物质分析

为探究传统酸面团的菌群结构及其对制成馒头风味物质组分的影响,分别对采自山西（SX）、河北（HB）、青海（QH）、甘肃（GS）和河南（HN）酸面团样品进行pH值、可滴定酸度（titratable acidity,TTA）和菌落总数的测定,运用高通量测序技术对5 个样品进行菌群结构解析,并采用顶空固相微萃取-气相色谱-质谱联用技术对其酵制馒头的风味物质进行检测与分析。结果表明：酸面团的pH值处于3.69～3.83之间,TTA范围为3.73～4.30 mL（0.1 mol/L NaOH溶液）,乳酸菌菌落数范围为4.89～8.31（lg（CFU/g））,酵母菌菌落数范围为4.75～6.08（lg（CFU/g））;酸面团中细菌的优势菌群为乳杆菌属、乳球菌属和魏斯氏菌属,真菌的优势菌群为酵母属、毕赤酵母属和假丝酵母属,且不同样品的优势菌属和相对丰度有所差异。酸面团样品酵制馒头风味物质的检测结果显示,共有42 种挥发性成分被检出,包括醇类、醛类、酯类、芳香类、烃类等;其中,HB样品检出成分最多,为30 种,SX、QH和GS样品为26 种,HN样品为25 种。不同馒头样品风味物质总含量排序为SX＞HN＞GS＞QH＞HB。     

酸汤子玉米面团中微生物多样性分析

酸汤子是我国北方地区一种营养丰富、风味独特的民族传统食品,深受满族及东北人民的喜爱。多样的微生物在酸汤子玉米面团的营养品质形成过程中,发挥着极其重要的作用,然而到目前为止,对满族传统发酵食品酸汤子面团中的微生物菌群多样性,仍不明确。以不同地区采集的酸汤子玉米面团为研究对象,利用聚合酶链式反应结合变性梯度凝胶电泳技术探究了酸汤子中微生物菌群多样性。结果表明:在9份酸汤子面团中共鉴定出14种真菌,分别为Saccharomyces castellii、Geotrichun candidum、Simplicillium lanosoniveum、Rhizochaete sulphurosa、Guehomyces pullulans、Debaryomyces hansenii、Fusarium culmorum、Trichoderma brevicompactum、Oryza lonqistaminata、Geotrichun fraqrans、Galactomyces candidum、G.geotrichum、Geotrichum sp.和Galactomyces sp.。鉴于S.castellii在多数样品中被检测,推测其为酸汤样品中真菌的优势发酵菌种。鉴定出4种细菌,分别是Bacillus pumilu、Lactobacillus tucceti、L.plantarum和Weissella paramesenteroides。由于W.paramesenteroides在多数样品中被检测出,推测其为酸汤样品细菌的优势菌群。     

Molecular identification of yeast species associated with 'Hamei'--a traditional starter used for rice wine production in Manipur, India

In Manipur state of North-Eastern India, wine from glutinous rice using traditional solid state starter called 'Hamei' is particularly interesting because of its unique flavour. A total of 163 yeast isolates were obtained from fifty four 'Hamei' samples collected from household rice wine preparations in tribal villages of Manipur. Molecular identification of yeast species was carried out by analysis of the restriction digestion pattern generated from PCR amplified internal transcribed spacer region along with 5.8S rRNA gene (ITS1-5.8S-ITS2). Seventeen different restriction profiles were obtained from the size of PCR products and the restriction analysis with three endonucleases (Hae III, Cfo I and Hinf I). Nine groups were identified as S. cerevisiae, Pichia anomala, Trichosporon sp., Candida tropicalis, Pichia guilliermondi, Candida parapsilosis, Torulaspora delbrueckii, Pichia fabianii and Candida montana by comparing this ITS-RFLP profile with type strains of common wine yeasts, published data and insilico analysis of ITS sequence data available in CBS yeast database. ITS-RFLP profile of eight groups was not matching with available database of 288 common wine yeast species. The most frequent yeast species associated with 'Hamei' were S. cerevisiae (32.5%), P. anomala (41.7%) and Trichosporon sp. (8%). The identity of major groups was confirmed by additional restriction digestion of ITS region with Hind III, EcoRI, Dde I and Msp I. The genetic diversity of industrially important S. cerevisiae group was investigated using Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). Although most of the 53 strains of S. cerevisiae examined were exhibited a common species specific pattern, a distinct degree of chromosomal length polymorphism and variable number of chromosomal DNA fragments were observed with in the species. Cluster analysis showed seven major karyotypes (K1-K7) with more than 83% similarity. The karyotype pattern K1 was the most frequent (67.9%) among the strains from different samples. Other karyotypes K2-K7 were very unique with less than 80% similarity. Finally using mitochondrial DNA restriction analysis (mt-DNA RFLP), S. cerevisiae strains belonging to the major karyotype K1 were distinctly differentiated with highly polymorphic bands by Hinf I and Hae III endonucleases.     

汾酒酒醅发酵过程中真菌群落的变化规律

In this work, the physicochemical properties of fermented grains for Fenjiu sampled at different time points of fermentation were evaluated, and the fungal community structure in it was analyzed by high-throughput sequencing. A comparative analysis was performed between the samples from primary and secondary fermentation. The results showed that the major nutrients and microbial metabolites in fermented grains changed regularly during the fermentation process. Significantly different trends in these compounds were observed between primary and secondary fermentation. Totally 98 fungal operational taxonomic units (OTUs) were obtained from fermented grains, and the diversity of fungi was significantly different between primary and secondary fermentation. The diversity of fungi increased first and then decreased in primary fermentation, while the diversity of fungi gradually decreased in secondary fermentation. The initial fungal communities in primary and secondary fermentation were similar to each other. Pichia was the dominant strain for both fermentation processes. However, the dominant fungi at the later stage of fermentation were quite different between them. Saccharomyces cerevisiae was the most dominant fungus in primary fermentation, and Candida was the most dominant fungus in secondary fermentation. The results from this study are of great significance to further study the metabolic pathway for key flavor substances and to improve the yield and quality of Fenjiu.     

基于高通量测序分析内蒙古地区传统酸面团中细菌菌群的多样性

该研究利用Illumina Miseq高通量测序技术对内蒙古西、中、东地区传统酸面团样品中的细菌菌群多样性进行解析,并结合PICRUSt软件预测细菌功能的变化。结果表明,传统酸面团样品共产生1 230 198条高质量序列,得到656个操作分类单元（OTU）;3个地区酸面团样品共检出3个优势细菌门和11个优势细菌属,共有优势细菌门为厚壁菌门（Firmicutes）和变形菌门（Proteobacteria）,共有优势细菌属为乳杆菌属（Lactobacillus）、明串珠菌属（Leuconostoc）、魏斯氏菌属（Weissella）和芽孢杆菌属（Bacillus）,不同地区样品间细菌菌群多样性和丰度存在明显差异。传统酸面团样品中细菌菌群的主要功能为碳水化合物代谢、辅助因子和维生素代谢、氨基酸代谢、脂质代谢及萜类化合物和聚酮化合物代谢。