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921.
从L-乳酸生产菌米根霉(Rhizopus oryzae)菌株AS 3.819基因组DNA中分别扩增得到了乳酸脱氢酶基因(ldhA)、丙酮酸脱氢酶基因(pdcA)、淀粉糖化酶基因(amyA)以及磷酸甘油酸酯激酶基因(pgk1)的启动子片段,并构建启动子探针载体pUKMR,以β-内酰胺酶基因(bla)为报告基因在大肠杆菌JM109中对这些启动子片段进行筛选及启动活性检测。结果表明:4 种启动子片段成功启动报告基因表达;在非底物诱导情况下,ldhA和pgk1启动子启动活性较强;在有合适碳源底物诱导情况下pdcA和amyA启动子拥有更高的启动活性;ldhA基因的启动子启动活性随着启动子片段长度的增加有一定提高,而在长度为500 bp以上时,其启动活性变化不明显。本研究为Rhizopus oryzae提供了一种快速简便的启动子捕获分离及启动活性检测方法。 相似文献
922.
为系统阐明金属抗菌肽SIF4基于DNA拓扑异构酶靶点的非细胞质膜抑菌机理,以大肠杆菌为模式菌株,研究了金属抗菌肽SIF4与基因组DNA的结合方式、对DNA拓扑异构酶I/II活性以及胞内核酸生物合成的影响机理。研究发现,金属抗菌肽SIF4可能以类似溴化乙锭嵌插方式与基因组DNA结合,对拓扑异构酶I有较强抑制活性,但对拓扑异构酶II影响较小,可通过影响DNA负超螺旋解链和RNA聚合酶结合催化RNA转录过程发挥抑菌活性。研究还发现,经金属抗菌肽SIF4处理12 h后,大肠杆菌胞内总DNA和总RNA生物合成量均受到不同程度的抑制,且呈现良好的量-效关系,1/2最小抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC)组与对照组(0 MIC)相比,胞内DNA和RNA生物量差异不显著(P>0.05),MIC和2 MIC组与对照组相比,胞内DNA和RNA生物量差异显著(P<0.05)。实验结果可为金抗肽SIF4在食源性大肠杆菌生物防控中的应用提供理论... 相似文献
923.
用支持向量机方法识别大肠杆菌启动子 总被引:3,自引:1,他引:2
为了进一步研究大肠杆菌启动子的识别算法,结合大肠杆菌基因分子生物学的有关理论,利用支持向量机(support vector machine,SVM)方法对启动子进行了识别.根据启动子的序列保守性,从每个启动子样本中选取了长65bases的序列作为正样本,从大肠杆菌编码区选取相应长度的序列作为负样本,建立了基于支持向量机的分类器;并讨论了应用SVM方法时,核函数参数的选择问题.实验结果表明,基于支持向量机的识别方法能更好地提取启动子保守序列的统计特征,正样本和负样本的相关系数可以达到81.62%. 相似文献
924.
大肠杆菌启动子特征元件对启动子识别的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
为了进一步研究大肠杆菌启动子的识别算法,根据大肠杆菌基因分子生物学有关理论与统计事实,对大肠杆菌启动子特征元件进行了研究.从启动子样本中选取不同的保守序列,采用2种神经网络结构.分别分析了启动子特征元件对识别的影响.研究发现.包含-10和-35区2个显著保守序列元件及其他几个非显著序列元件时,正样本和负样本的识别率最高,达到77.67%和88.45%.实验结果为进一步研究启动子的特征提取和识别算法提供了参考. 相似文献
925.
926.
927.
928.
以明胶为载体,戊二醛为交联剂,采用包埋-交联复合固载法固定大肠杆菌细胞,研究明胶浓度、菌体加入量和戊二醛对固定化大肠杆菌细胞谷氨酸脱羧酶活力的影响,并将固定化大肠杆菌细胞用于制备γ-氨基丁酸.结果表明:0.1g大肠杆菌菌粉分散在30mL、13%的明胶溶液中,转变成凝胶后再用0.5%戊二醛溶液20mL交联2h,固定化细胞的谷氨酸脱羧酶活力最高;采用15g固定化细胞在pH值为4.0、温度40℃转化20.0mL、60mmol/L的L广谷氨酸底物,反应11h的转化率达95%,重复进行6次转化反应,转化率达95%的时间是20h.该包埋-交联法固定化大肠杆菌细胞在制备γ-氨基丁酸上有较好的工业化应用前景. 相似文献
929.
930.