乳粉中阪琦肠杆菌的PCR检测

针对我国食品进出口和生产卫生的需要,使用以16 S rRNA基因为靶序列设计合成了一对可扩增282 bp的目的片段的引物,建立了检测阪琦肠杆菌的PCR方法.结果表明,阪琦肠杆菌PCR产物有282 bp的特异性片段,而金黄色葡萄球菌无此目的条带,证实该引物具有特异性.该方法快速、可靠、灵敏,特异性强,可用于食品中阪琦肠杆菌的检测.     

植物乳杆菌P8亚油酸异构酶基因及其上游非编码区的克隆与分析

依据GenBank中已公布的亚油酸异构酶基因,设计一对特异性引物,PCR扩增该基因后,克隆到T载体上并转化到Trans1-T1感受态细胞中。经菌落PCR鉴定和序列分析表明,亚油酸异构酶基因大小为1720bp。该基因与植物乳杆菌AS1.555(DQ227322)的同源性达到99%,与泡菜植物乳杆菌(DQ010331)的同源性达到89%。该基因序列在GenBank上注册,编号为HM569265,对其进行生物信息学分析发现,基因中含有一段低复杂性区域。分析乳酸杆菌(CP001617)基因组全序列,设计了亚油酸异构酶基因上游非编码区805bp片段的特异性引物,PCR扩增该片段后将其克隆到T载体上并转化到Trans1-T1感受态细胞中。经菌落PCR鉴定后,进行序列分析和生物信息学的初步分析,预测出该片段中有12个基序,以及6个转录调控元件。     

PCR法检测肉制品中鹅源性成分

目的 建立一种PCR法检测肉制品中鹅源性成分的方法。方法 根据鹅的线粒体DNA(mtDNA)序列设计引物, 以9种动物的DNA为模板, 利用新设计的鹅的特异性引物进行PCR反应, 并用琼脂糖凝胶电泳检测引物的特异性和敏感性。结果 通过PCR反应, 仅鹅的DNA扩增得到了194 bp的目的片段, 其余物种DNA和空白对照均无目的片段。扩增产物的核苷酸序列与GENBANK中检索到的相应序列基本相符合。 结论 该方法特异性强、灵敏度高, 适合检测肉制品中的鹅源性成分。     

三引物PCR检测牛羊猪源性成分的方法

建立了三引物PCR鉴定牛羊猪源性成分的方法,为肉类及产制品掺假鉴定或肉品溯源提供了简单易行的方法。通过对比牛羊猪的线粒体DNA(mt DNA)全序列,在保守区设计通用引物,在特异性区域设计特异引物并结合三引物PCR技术,扩增3个物种的特异性片段,羊、牛和猪产生片段大小分别为570、549、420 bp,依据片段大小可以在一次PCR中鉴定3个物种。建立的方法简单易行,特异性和灵敏度好,可以在肉类及产制品鉴定和溯源中应用,提高了检测效率。     

聚合酶链反应检测食品中的沙门氏菌

参考沙门氏菌侵袭性基因invA的序列,设计合成一对引物扩增其中一段序列,建立了特异性检测沙门氏菌的PCR方法。引物两端分别加了Bam HI和EcoR I切点,扩增片段大小为300bp。对收集的50个血清型123株沙门氏菌及7种23株非沙门氏菌进行PCR检测,结果仅沙门氏菌有300bp的扩增产物,显示了很强的特异性,为下一步克隆而设计的两个酶切位点对引物的特异性没有影响。经琼脂糖凝胶电泳,PCR的检出极限是10pg染色体DNA和10~2 cfu的细菌。将扩增产物经slot—blot与辣根过氧化物酶(HRP)直接标记的invA基因探针杂交,经增强型化学发光反应(ECL)及化学发光自显影(CPD)检测,可提高检测的敏感性一个数量级,同时增加了特异性。为推广应用,本文试验了8种模拟食品样品对PCR反应的影响,结果除奶酪外,其余都得到较好扩增。对120份污水及食品样品进行检测,该检测系统检出70份阳性结果,检出率高于常规分离。初步应用显示,PCR检测方法敏感、特异、简便、快速,适合于食品卫生检验和临床标本检验的现场应用。     

基于同源加尾系统的双重实时PCR方法鉴定混合肉样中猪成分比例

为了对掺入猪肉成分的比例进行鉴定,本研究拟建立基于同源加尾系统(Homo-tag Assisted Non-dimer system,HANDS)的双重实时PCR检测方法,借助简易数学模型将实时PCR的Ct值(循环阈值)换算成猪肉成分的百分比。根据常见家畜、家禽染色体中的管家基因Myostatin序列设计家禽家畜通用引物和探针序列,针对猪染色体beta actin基因设计猪源性成分特异型引物和探针序列,并在所有引物5’端加上同源引物。通过评估以上两套引物和探针的通用性,特异性,优化引物和探针浓度、退火温度,构建同源加尾双重实时PCR检测方法对不同猪源性成分比例的肉样进行检测并换算Ct值得出混合肉样中猪源性成分的比例。所构建的同源加尾双重实时PCR方法两重之间扩增效率相近,通用性引物、探针可以扩增所有家畜家禽成分,特异性引物探针只扩增猪源性成分。通过检测制备的混合肉样显示,该方法换算结果与肉样实际比例接近。     

纳豆芽孢杆菌和嗜酸乳杆菌融合子的多重PCR鉴定

为建立纳豆芽孢杆菌和嗜酸乳杆菌融合子快速鉴定的多重聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)方法,根据芽孢杆菌的芽孢形成早期因子基因spo0A和13株乳酸菌β-半乳糖苷酶基因的保守序列分别设计引物对P1/P2和P3/P4,以亲本菌株DNA为模板,优化每对引物在适宜退火温度条件下的PCR体系,在最优体系下的特异性分析结果表明P1/P2能特异性扩增出spo0A基因片段(308 bp),而7株乳酸菌全部呈阴性;P3/P4可扩增出所有受试乳酸菌和经表型鉴定确定的阳性融合子中的目标基因片段(576 bp),而对芽孢杆菌无扩增。多重PCR结果表明在P1/P2的最优体系中只有308 bp片段的扩增,而在P3/P4的最优体系中可实现2个片段的共扩增,对融合后获得的50个菌株的鉴定结果与单重PCR和表型鉴定结果100%吻合。该体系中模板DNA 1 ng/μL,每条引物0.4μmol/L,脱氧核糖核苷三磷酸0.25 mmol/L,Taq酶0.06 U/μL;PCR时94℃预变性5 min;每个循环(共30个)94℃30 s、53℃30 s、72℃60 s,产物末端72℃延伸7 min。该方法简便、快速、特异性好,适用于芽孢杆菌、乳酸菌以及二者融合子的快速鉴定。     

四重PCR结合全自动电泳系统检测食品转基因成分

根据转基因食品中最常见的四种外源元件(CaMV35S启动子、NOS终止子、cry1Ab/cry1Ac基因、bar基因)的核苷酸序列,设计特异性检测引物,扩增产物大小分别为101、180、301、430bp,通过引物浓度、退火温度的优化,特异性、灵敏度测试,并结合微流体芯片全自动电泳技术,建立了同时检测这4个参数的四重PCR方法。结果表明,该方法可特异性地从复杂样品中检测出预期转基因成分,检测灵敏度达到0.1%。本方法特异性好,灵敏度高,适用于食品中转基因成分的快速筛查。     

运用PCR技术进行5种液态奶的鉴别

采用聚合酶链式反应(PCR)对牛奶、羊奶、水牛奶、骆驼奶、黄豆奶这五种液态奶进行鉴别。其中,羊奶以ATP6为目的基因设计其特异性引物,能扩增出大小为292 bp的DNA片段,水牛奶以12SrRNA为目的基因设计特异性引物对,扩增出大小为328 bp的DNA片段,牛奶、骆驼奶以细胞色素b(cyt b)为目的基因设计引物,可以分别扩增出大小为725 bp和363 bp的DNA片段,黄豆浆以细胞色素f(cyt f)为目的基因,扩增出大小为510 bp的DNA片段,各引物对对于其它物种奶类无特异性扩增,并采用两种限制性内切酶验证了该扩增的特异性。通过不同物种的基因序列差距设计的引物,能同时鉴别出这几种液态奶,是一种可靠、简单、快捷的液态奶鉴别方法。     

肉食品中兔源性成分的PCR-mtDNA检测

以兔肌肉组织DNA为模板,利用PCR-mtDNA技术成功克隆出兔线粒体DNA细胞色素酶Ⅲ基因,其序列包括兔COⅢ基因的全序列784 bp。利用设计好的引物P3、P4,PCR扩增兔DNA的特异性片段为230bp。对PCR产物进行测序分析可知,其与已克隆兔的mtDNACOIII基因同源性达到100%。对筛选出的特异性引物P3、P4进行灵敏度试验,结果分析表明灵敏度约为0.001%。根据试验,对mtDNA技术用于兔源性食品检测进行研究,为检测肉食品中兔源性成分提供实用、有效的方法,为以后PCR-mtDNA在兔源性食品检测方面的应用提供理论依据。     

PCR鉴别猪鸡兔肉方法的建立与应用

建立一种快速准确鉴别生鲜猪肉、鸡肉和兔肉,以及混合或加工过的肉制品中这3种肉成分的方法。以猪肉、鸡肉和兔肉的线粒体细胞色素b基因为特征靶基因设计3组特异性引物对:F/R猪、F/R鸡和F/R兔,通过PCR得到特异性扩增片段,分析电泳图中是否出现目标条带,进而检测肉样是否掺假。结果表明,所设计的引物特异性良好,猪肉DNA扩增后产生331 bp的特异性条带,鸡肉DNA扩增后产生148 bp的特异性条带,兔肉DNA扩增后产生258 bp的特异性条带,而其他肉类未见该特异性条带。该方法准确、稳定,可为猪肉鉴别真假提供技术支持。     

SYBR(R) GreenⅠ实时PCR快速检测沙门菌

为应用SYBR(R) Green Ⅰ实时PCR技术建立沙门菌的快速检测方法,根据沙门菌invA基因序列的特点设计特异性引物,进行SYB(R) Green Ⅰ实时PCR检测.以沙门菌及非同源性参考菌株做特异性检测;沙门菌不同群菌株做重现性检测;将沙门菌菌株稀释成不同梯度,做灵敏度检测.该方法有较好的特异性、重现性,沙门菌属5个群菌株均为阳性,而其它非同源菌株均为阴性.该方法灵敏度较高,检测低限为19 CFU/ml.该方法特异性强,重现性好,敏感性高,可以快速、准确检测食品中沙门菌.应用实时PCR技术,利用SYBR(R) Green Ⅰ染料能选择性结合双链DNA的特点,可检测到沙门菌中inv A基因特异性靶序列扩增所产生的荧光信号,且通过熔解曲线可知其熔点值约为80.4℃,而对其它非沙门菌则检测不到荧光信号.SYBR(R) Green Ⅰ实时PCR能通过熔解曲线有效地区分特异性产物、非特异性产物以及引物二聚体,是基因鉴定检测的新方法.     

应用多重PCR检测食品中SARS病毒靶基因的初步研究

以分子生物学方法——聚合酶链式反应(PCR)技术为基础,初步探讨了食品中SARS病毒靶基因片段的多重PCR检测技术。根据GenBank公开发表的SARS病毒基因组cDNA序列,人工合成克隆特异性靶基因DNA片段,以此片段作为阳性对照,并将其添加到罐装蘑菇、牛肉干、大豆、鱼干等食品的cDNA中作为阳性样品,再根据世界卫生组织推荐的引物序列合成引物,进行单PCR与多重PCR检测分析。结果表明:以单PCR法获得了121bp、182bp及302bp3条靶基因片段;以二重PCR法获得了121bp+182bp、121bp+302bp与182bp+302bp的靶基因片段组合;以三重PCR法获得了121bp+182bp+302bp的靶基因片段组合。检测灵敏度的实验表明:182bp片段的模板DNA量在0.003ng以上时,单PCR都能扩出清晰的条带,而121bp的靶基因片段只有模板DNA量在0.03ng以上时,单PCR才能扩出清晰的条带。它们的二重PCR分析的灵敏度与相应的单PCR分析灵敏度相同。     

PCR技术检测编码绿脓杆菌外毒素A基因

根据编码绿脓杆菌外毒素A基因设计引物,应用PCR技术检测绿脓杆菌外毒素A基因。从绿脓杆菌中扩增出402bp外毒素A基因。测序结果表明,与已发表序列同源性为100%。PCR敏感度试验表明,可检测到含量为3cfu/mL的绿脓杆菌。从绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、乳酸菌菌液中特异性地检出编码绿脓杆菌外毒素A基因。该技术具有简易、敏感、快速和特异性强等特点,可用于食品和细菌感染的绿脓杆菌菌株的鉴定。     

利用简并引物检测金黄色葡萄球菌肠毒素A、B基因

通过设计简并引物建立一种PCR技术同步快速检测金黄色葡萄球菌肠毒素A和B基因的方法。根据金黄色葡萄球菌肠毒素A、B基因编码序列,设计一对特异性简并引物SEAB来扩增靶基因片段,长度分别为105bp和135bp,通过对金黄色葡萄球菌肠毒素A、B菌株和4株对照菌株进行PCR检测,评价该引物的特异性;对金黄色葡萄球菌肠毒素B的DNA系列10倍稀释,对其灵敏性进行PCR检测。结果显示,金黄色葡萄球菌肠毒素A和B菌株的DNA检测结果呈阳性,4株对照菌株的检测结果呈阴性,通过基因测序证实了PCR产物的特异性,SEB的DNA最低检测浓度为3.58ng,整个检测过程不超过20h。建立了一个特异、快速灵敏的在同一条件下,金黄色葡萄球菌肠毒素A、B基因的PCR检测方法。     

羊肉与鸭肉的分子生物学鉴别技术

本研究建立羊肉与鸭肉的分子生物学鉴别方法,以羊肉和鸭肉线粒体细胞色素b基因(cytb)为特征靶基因,设计1条通用上游引物F和2条特异性下游引物:R_羊、R_鸭,并按照一定浓度比例组成混合引物,进行一次聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增即可获得目的DNA片段,根据琼脂糖凝胶电泳的DNA条带大小来判断羊肉中是否掺杂鸭肉。结果表明:当被检样本在367 bp和480 bp处分别出现特异性条带时,说明该样本的羊肉中掺杂了鸭肉;当被检样本在367 bp处出现特异性条带,而在480 bp处未出现特异性条带时,则说明该样本的羊肉中没有掺杂鸭肉。该方法准确、可靠、简单快捷,可用于食品中肉类种属的筛选和肉类掺假的检测和监管。     

海狸鼠源性成分的PCR鉴别研究

以海狸鼠和其他物种的细胞色素b基因为目标基因,通过序列比对在碱基差异明显的区域设计海狸鼠的特异性引物,并通过退火温度、反应循环数、方法检出限和特异性等参数的考察建立海狸鼠源性成分的聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)鉴别方法。结果显示:该PCR方法对海狸鼠能够扩增出约599 bp的条带,对其他物种无任何扩增现象,且在鸡肉和兔肉中对海狸鼠成分的检出限可达到0.1%。这表明该方法有较好的特异性和较高的灵敏度,能够满足海狸鼠源性成分的检测要求。     

大西洋三文鱼和虹鳟鱼双重PCR检测方法的建立及应用

为了实现大西洋三文鱼和虹鳟鱼的物种掺假快速检测,本研究建立了一种基于双重PCR（普通和荧光）的物种鉴定方法。通过序列分析,分别基于线粒体COⅠ和Cyt b基因设计大西洋三文鱼和虹鳟鱼特异性引物,验证引物的特异性并对双重PCR反应体系进行优化,建立大西洋三文鱼和虹鳟鱼的双重PCR快速鉴定方法。利用本研究设计的引物,仅大西洋三文鱼和虹鳟鱼可以分别扩增出108 bp和207 bp的特异性条带,而其他23种非目标物种均未有扩增条带。经验证,在双重PCR反应体系中,大西洋三文鱼和虹鳟鱼引物的最佳添加量分别为0.1和0.4 μmol/L,熔解温度分别约为81.5 ℃和85 ℃。利用该方法从29份市售“三文鱼”样品中检测到6份大西洋三文鱼和3份虹鳟鱼,且与DNA条形码比对结果一致。本研究建立的大西洋三文鱼和虹鳟鱼双重PCR（普通和荧光）鉴定方法具有良好的特异性和适用性,为大西洋三文鱼和虹鳟鱼物种鉴定提供了可靠的技术手段。     

基于分子信标技术的肉类食品动物源性成分多重筛检方法

建立一种基于通用型分子信标检测及探针熔解曲线分析技术的肉类食品动物源性成分多重筛检方法。通过对猪、牛、羊等9种常见食用畜禽动物基因组多序列比对及生物信息学分析,选取线粒体基因组16s r DNA中具有特定结构的基因片段作为检测靶序列,设计单一的通用型引物和长链分子信标。以标准基因重组载体及实体样品基因组为检测对象,确定各动物源性成分特征退火温度(Tm),建立基于实时荧光PCR及熔解曲线分析的标准检测方法,并对筛检方法的灵敏度和特异性进行考察。应用所建立检测方法,9种畜禽动物基因组扩增产物单一,测序结果与参考序列一致。对梯度稀释的猪标准基因重组载体检测发现,终浓度10⁸～10¹copies/μL模板扩增Ct值范围为15～36个循环(回归系数R²=0.99),熔解峰特征Tm为(68.0±0.1)℃。对9类畜禽肉类标准基因重组载体和实体样品进行独立检测,各类动物源性基因均形成可辨识的特异性熔解峰(Tm分别为猪68.0℃、牛64.3℃、羊65.1℃、驴65.8℃、马63.4℃、驼60.6℃、狗61.8℃、鸡52.6℃、鸭56.7...     

单增李斯特菌与志贺氏菌多重PCR检测技术的建立

目的:为食品、卫生行业提供一种简便、灵敏、快速,并且特异性强的单增李斯特菌(Listeria Monocyto-genes)与志贺氏菌(Shigella)多重PCR检测方法.方法:根据单增李斯特茵转录调节子基因prfA、志贺氏茵侵袭性质粒抗原H基因ipaH筛选出引物;优化多重PCR的引物浓度、退火温度及Mg2+等条件,分析单-PCR及多重PCR的特异性、灵敏度;结合24 h增茵培养.确定多重PCR检测人工污染脱脂灭茵乳的检出限.结果:多重PCR扩增出了预计的PCR产物,即单增李斯特茵(274bp)和志贺氏茵(421bp).该方法的灵敏度:78 pg单增李斯特茵基因组DNA、7.5pg志贺氏茼基因组DNA.多重PCR检测人工污染脱脂灭菌乳,单增李斯特茵与志贺氏茵的灵敏度分别为2cfu/25mL和1.6cfu/25mL.结论:该方法在食品、卫生行业具有很好的应用和开发前景.